Mikro RNS mintázat vizsgálata szájüregi laphámrákos betegek nyálmintájában

Dátum
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

A szájüregi daganatos esetek közel 90%-át teszik ki a szájüregi laphámsejtes karcinómák (OSCC). A diploma munkámhoz kapcsolódó kutatómunka célja a szakirodalomban korábban már leírt, lehetséges OSCC-specifikus nyál miRNS (miR-31-5p, miR-184-3p, miR-191-5p, miR-345-5p, miR-424-3p, miR-21-3p) biomarkerek validálása a több hazai vizsgálóhelyen gyűjtött nyálmintákban. A minták kvantitatív valós-idejű PCR amplifikációját követően az értékeket normalizáltam a SNORD60 referencia génhez, majd ezekből a normalizált értékekből statisztikai analíziseket (Mann-Whitney U teszt, ROC görbe analízis) végeztem. A hat vizsgált miRNS közül négy szignifikánsan magasabb expressziós szintet mutatott a beteg minta csoportokban a kontroll csoportokhoz képest: miR-31-5p (p=0.0015) miR-191-5p (p=0.0005), miR-345-5p (p=0.0003), miR-21-3p (p=0.0117), egy pedig szignifikánsan alacsonyabb mennyiségben volt jelen: miR-424-3p (p=0.004). A szignifikánsnak mutatkozó minták értékeiből ROC (Receiver Operating Characteristic) analízist végeztem: miR-31-5p (AUC=0.6714) miR-191-5p (AUC=0.6780), miR-345-5p (AUC=0.7749), miR-424-3p (AUC=0.7383), miR-21-3p (AUC=0.6351). Az eredmények arra engednek következtetni, hogy külön egyik vizsgált miRNS sem elég specifikus és szenzitív potenciális OSCC biomarkerként. További vizsgálatok során nagyságrendekkel több lehetséges miRNS azonosítására alkalmas ún. „high throughput” módszert kívánunk fejleszteni a hazai OSCC betegek nyálmintájából kimutatható, a jelenlegi miRNS biomarkereknél megfelelőbb miRNS biomarkerek azonosítása céljából.

Leírás
Kulcsszavak
mikro RNS, OSC, nyálminta
Forrás