Batta, GyulaKerner, Kinga2019-01-172019-01-172018http://hdl.handle.net/2437/263041Az egyre növekvő antibiotikum rezisztencia kialakulása miatt egyre sürgetőbb feladat a hatékonyabb terápiás eljárások kidolgozása a súlyos, gyakran halálos kimenetelű fertőzések leküzdéséhez. Ehhez szükség van többek közt olyan új antifungális fehérjékre, melyek nem toxikusak a humán felhasználás során. Az egyik ilyen – néhány éve felfedezett – kis diszulfid fehérje az NFAP2. Az NFAP2 Candida-ellenes fehérje korábbi NMR spektroszkópiai jelhozzárendelése nem volt teljes, mert néhány aminosav – 3Thr, 4Ser, 16Lys, 17His és részlegesen a 22Gly – nem adott jelet a spektrumokban. A jelek hiányának az lehet az oka, hogy a kérdéses egységek a fehérje – NMR időskálán – dinamikus régiójában találhatók. NMR módszerekkel a mozgékony régiók akkor jellemezhetők jól, ha a jelek egyáltalán észlelhetők. NMR relaxációs vizsgálataink azt mutatták, hogy a nem detektált aminosav egységek a mozgékonynak talált, ám még detektálható egységek közelében vannak ami korábbi feltételezésünket igazolja. Ez a fehérjén belül elsősorban a 2-5, valamint a 15-22 szekvencia részletet jelenti. Szegedi kutatók azonosították az NFAP2 fehérje antifungális hatásáért felelős részét, mely átfed az általunk talált dinamikailag aktív régiókkal. Mivel az NFAP2 fehérje NMR szerkezetmeghatározása a hiányzó jelek, illetve a mozgékony régiók jelenléte miatt nehézségekbe ütközik, így szerves makrociklusos molekulákhoz való komplexálással próbáltuk stabilizálni az NFAP2-t. Ez a módszer a PAF antifungális fehérjénél korábban már működött; lehetővé tette a PAF kristályosítását, és röntgendiffrakciós szerkezetmeghatározását. A komplex képzés igazolásához szulfonátokalix[n]arén, n = 4, 6, 8 vegyületekkel titráltuk a 15N jelölt NFAP2-t, amit a kétdimenziós 15N-1H NMR HSQC spektrumok felvételével követtünk. Két makrociklus kötődését észleltük (n = 4, 6), míg n=8 esetén nem végeztünk kísérleteket. Azt reméljük, hogy az NFAP2 szerkezete egy alkalmas komplexben stabilizálódhat, ami lehetővé teszi az NMR oldatfázisú, és / vagy a röntgen-krisztallográfiai térszerkezet meghatározását.37huNFAP2antifungális fehérjerelaxációkalixarénekfehérjedinamikaDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Biofizika