Pfliegler, Valter PéterHorváth, Gergő2024-06-242024-06-242024-04-25https://hdl.handle.net/2437/374700Szakdolgozatom során hat törzs filo-és komparatív genomikai összehasonlítására került sor. Ezen törzsek közül adottak XX. század eleji tokaji borélesztők és recens minták (S. cerevisiae). Illumina technológiával való szekvenálás után a nyers szekvenciákat algoritmusok segítségével (pl. FASTP, BWA-MEM, SAMtools) tisztítottuk és megfelelő formátumba helyeztük különböző szoftverek számára (pl. IGV), melyekkel in silico vizsgálható a törzsek filogenetikai elhelyezkedése és a genomjukban található allélok. A törzseket a Molekuláris Biotechnológiai és Mikrobiológiai Tanszék publikálatlan törzsgyűjteményével hasonlítottuk össze, kládokba soroltuk őket. IGV szoftverrel vizualizáltuk az illesztett read-eket, bemutattunk SNP-ket és hiányzó genomrégiókat. Allélfrekvencia-diagramokat generáltunk és elemztünk variánsok előhívásával, lefedettségi térképezéssel introgressziót, szegmentális és teljes kromoszómaduplikációt vizsgáltunk. Kis mértékű introgresszió volt megfigyelhető két rokonfajból. A lefedettségi térképezés során főképpen a szegmentális duplikáció volt megfigyelhető telomer régióknál. Az allélfrekvencia-vizsgálat során kiderült, hogy 3 vizsgált törzs homozigóta a genomjuk legnagyobb részére vonatkoztatva, 3 pedig döntően heterozigóta. A törzsfára való illesztés után kiderült, hogy a vizsgált törzseim két kládba sorolhatóak: Európai bor ill. a Prize de Musse/kvevri klád.46huÉlesztő Filogenetika Élesztő diverzitás TerroirBiológiai tudományokHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.