Posztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon, 2007-2011

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorBányai, Krisztián
dc.contributor.advisorKónya, József
dc.contributor.authorAntalné László, Brigitta
dc.contributor.authorvariantLászló, Brigitta
dc.contributor.departmentGyógyszertudományok doktori iskolahu
dc.contributor.submitterdepDE--OEC--Általános Orvostudományi Kar -- Orvosi Mikrobiológiai Intézet
dc.contributor.submitterdepDE--OEC--Általános Orvostudományi Kar -- Orvosi Mikrobiológiai Intézet
dc.contributor.submitterdepDE--OEC--Általános Orvostudományi Kar -- Orvosi Mikrobiológiai Intézet
dc.date.accessioned2013-03-19T11:17:07Z
dc.date.available2013-03-19T11:17:07Z
dc.date.created2013hu_HU
dc.date.defended2013-04-10
dc.date.issued2013-03-19T11:17:07Z
dc.description.abstractAz A-csoportú rotavírusok okozta gyermekkori akut gastroenteritisek megelőzésében a vakcináció játssza a főszerepet. Az új generációs Rotarix® és RotaTeq® rotavírus vakcinák 2006-os bevezetése óta a törzsmonitorozás világszerte még fontosabbá vált. Ezért 2007-ben Magyarország részvételével megalakult az Európai Rotavírustörzs-figyelő Hálózat (EuroRotaNet), melynek célja, hogy a konzorcium tagországaiban összehangolt posztvakcinációs törzsmonitorozást végezzen. A hálózat tagjaként a mi munkánk célja a Magyarországon cirkuláló rotavírus törzsek relatív gyakoriságának, térbeli és időbeli változásának és a vakcinák törzsgyakoriságokra gyakorolt hatásának felmérése volt. Vizsgálatainkhoz akut gastroenteritises, többségében 5 éven aluli betegektől származó rotavírus pozitív székletmintákat gyűjtöttünk az ország 8 régiójából 2007-2011 között. Genotipizálási vizsgálatainkat a vírus G és P felszíni antigénjeire specifikus multiplex reverz-transzkripciós nested-PCR segítségével végeztük. A törzsek közötti genetikai kapcsolatok megállapításához szekvencia- és filogenetikai elemzéseket is végeztünk. Munkánk során 2380 rotavírus törzs felszíni antigénjeinek genotipizálását végeztük el. A vizsgált időszakban összesen 17 különböző antigénkombinációt írtunk le, amelyek között a leggyakoribbak a globális elterjedést mutató G1P[8] 44,9%; G4P[8] 23,4%; G2P[4] 14,8% és G9P[8] 6,8% voltak. Az egyébként világszerte gyakori G3P[8] törzs előfordulása hazánkban nem érte el az 1%-ot. Az általános törzsek mellett kisebb számban ritka antigénkombinációkat is azonosítottunk: G1P[4], G1P[6], G2P[6], G2P[8], G3P[4], G3P[9], G4P[6], G6P[9], G9P[4], G9P[6], G12P[6] és G12P[8]. Ezek együttes előfordulása azonban alig haladta meg a 4%-ot. A leggyakoribb genotípusok relatív gyakorisága évről évre és földrajzi területenként is változott. Szekvencia- és filogenetikai elemzéseinkből kiderült, hogy a 2007-ben azonosított G9P[6] genotípusú törzsek Indiából kerültek behurcolásra, és fény derült néhány PCR tipizálási hibára is (pl. G6 és G12 törzsek esetében). A közösségi törzsek és a vakcinatörzsek VP4 és VP7 génjeinek szekvencia összehasonlítása nem tárt fel közvetlen genetikai kapcsolatot a két csoport között, habár találtunk a Rotarix® törzshöz hasonló G1 és P[8] típusú vírusokat. Magyarországon a Rotarix® vakcina használata terjedt el elsősorban, de a célpopuláció átoltottsága alacsony (~18%). A Magyarországon cirkuláló, járványtani szempontból fontos rotavírus törzsek a vizsgálat adatai szerint szinte teljes átfedést mutatnak a vakcinákban is megtalálható antigéntípusokkal, így a rotavírus elleni vakcináció szélesebb körben történő hazai elterjedése segíthet mérsékelni a rotavírus-fertőzések okozta szociális és gazdasági terheket. --- Vaccination is the main strategy to control severe dehydrating gastroenteritis caused by rotaviruses in early childhood. The introduction of new generation rotavirus vaccines, Rotarix® and RotaTeq®, has resulted in an intensification of strain surveillance worldwide to monitor strain prevalence across countries. An international strain surveillance network (EuroRotaNet) was launched in 2007 in Europe with the participation of Hungary. In the present study, the geographical and temporal distribution of human rotavirus G and P types and the impact of vaccine use on strain prevalence and diversity in Hungary is reported. Rotavirus positive stool samples were collected from patients, mostly children <5 years of age with gastroenteritis in 8 geographic areas of Hungary between 2007-2011. Viral RNA was amplified by multiplex genotyping RT-PCR assay, targeting the medically most important G and P types. Sequencing of the VP4 and VP7 genes was performed to monitor the genetic relatedness of rotavirus strains. In total, 2380 strains were genotyped. During the five-year surveillance 17 different antigen combinations were identified with the dominating prevalence of genotype G1P[8] (44,9%) strains, followed by G4P[8] (23,4%), G2P[4] (14,8%) and G9P[8] (6,8%). The prevalence of common G3P[8] strain remained below 1% in our country. Additional rare genotypes were identified in a low percentage of samples (4.12%): G1P[4], G1P[6], G2P[6], G2P[8], G3P[4], G3P[9], G4P[6], G6P[9], G9P[4], G9P[6], G12P[6] és G12P[8]. The prevalence of common strains fluctuated both in the consecutive years and between geographical regions in the same rotavirus season. Sequence and phylogenetic analyses revealed evidence for the imported G9P[6] strains from India and some primer mistyping in our PCR assay (G6 and G12 strains). The sequence determination and comparison of VP4 and VP7 genes of selected field strains and vaccine strains did not prove direct genetic relatedness between them. However, G1 and P[8] types closely related but not identical with Rotarix® parental strain were determined, their vaccine origin was unlikely. Rotarix® was purchased more often, but the nationwide vaccine coverage among infants remained low (~ 18%). Our data indicates that the antigen specificities of medically important rotavirus strains identified in our country are represented in the vaccines available in the pharmaceutical private market in Hungary. The intensification of vaccine use in the forthcoming years may help to decrease the socio-economic burden of rotavirus infections.hu_HU
dc.description.correctorNE
dc.format.extent76hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/162021
dc.language.isohuhu_HU
dc.language.isoenhu_HU
dc.subjectrotavírushu_HU
dc.subjectrotavirushu_HU
dc.subjectEuroRotaNet
dc.subjectsurveillance
dc.subjectvakcináció
dc.subjectP-típus
dc.subjectG-típus
dc.subjectgenotipizálás
dc.subjectgastroenteritis
dc.subjectEuroRotaNet
dc.subjectsurveillance
dc.subjectvaccination
dc.subjectP-type
dc.subjectG-type
dc.subjectgastroenteritis genotyping
dc.subject.disciplineGyógyszertudományokhu
dc.subject.sciencefieldOrvostudományokhu
dc.titlePosztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon, 2007-2011hu_HU
dc.title.translatedPostvaccination rotavirus surveillance in Hungary, 2007-2011hu_HU
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 5 (Összesen 5)
Nem elérhető
Név:
Antalné_László_Brigitta_summary_secured.pdf
Méret:
9.32 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Summary
Letöltés
Nem elérhető
Név:
Antalné_László_Brigitta_értekezés_secured.pdf
Méret:
1.43 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Értekezés magyarul
Letöltés
Nem elérhető
Név:
Antalné_László_Brigitta_meghívó_secured.pdf
Méret:
43.31 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Meghívó
Letöltés
Nem elérhető
Név:
Antalné_László_Brigitta_tézisek_angol_secured.pdf
Méret:
412.55 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Tézisek angolul
Letöltés
Nem elérhető
Név:
Antalné_László_Brigitta_tézisek_magyar_secured.pdf
Méret:
514.96 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Tézisek magyarul
Letöltés
Gyűjtemények
Gyógyszerészeti Tudományok Doktori Iskola