Egy skorpió mérgéből izolált peptid toxin, a Cm39 szerkezetvizsgálata modern NMR és számításos kémiai módszerekkel

Abstract

A diplomamunkám témája a Cm39 szerkezetvizsgálata, ami a Centruroides margaritatus-ból izolált 37 aminosavból álló, 3980 Da molekulatömegű peptid toxin. A Cm39 aminosav szekvenciája jelentős hasonlóságot mutat számos skorpiótoxinnal, amelyek inhibítorai a feszültségfüggő kálium ioncsatornáknak (Kv). A biológiai aktivitás és a toxin-csatorna kölcsönhatás teljeskörű megértéséhez elengedhetetlen a peptid szerkezetének ismerete. A kutatási munkám elsődleges célja a peptid 3D szerkezetének meghatározása volt modern NMR és számításos kémiai módszerekkel. Továbbá célul tűztem ki olyan molekuladinamikai számítások elvégzését is, amelyek segítségével összehasonlíthatom a peptid cisztein alegységei között kialakult különböző kén hidak által meghatározott szerkezetek időbeli stabilitását és esetleges konformációs változásait, mely információkból további következtetések vonhatók le a kapott szerkezetek jóságát illetően.