Sejtklaszterek dinamikájának mérése

dc.contributor.advisorHajdu, András
dc.contributor.authorSzikszai, László
dc.contributor.departmentDE--TEK--Informatikai Karhu_HU
dc.date.accessioned2012-06-06T07:46:25Z
dc.date.available2012-06-06T07:46:25Z
dc.date.created2012-05
dc.date.issued2012-06-06T07:46:25Z
dc.description.abstractInkubátorban növő sejtek (Human Caucasian colon adenocarcinoma) 10X nagyítású mikroszkóp objektívvel előállított képét egy optikájától megfosztott webkamera (Genius Eye 110) rögzíti. MATLAB-ból vezérelve percenként készül felvétel (RGB24_352x288), akár több napon keresztül is. A képek általában már több (akár 100) sejtből álló klasztereket és nem egyedi sejteket mutatnak. A célkitűzés számszerűsíteni a látottakat, jellemezni a sejtklaszterek dinamikáját. Ehhez az egyes sejtklaszterek precíz meghatározása (szegmentálása) szükséges, mely után már meghatározhatóak azok bizonyos tulajdonságai – úgymint: kerület (fluktuáció), terület – és ezek időbeni eloszlása. Az egyes képek feldolgozásakor fontos, hogy megtaláljuk azokat az előfeldolgozó technikákat, melyekkel optimális jellemzők (feature-ök) nyerhetők ki a képekből a szegmentációs eljáráshoz, illetve a zajok, az egyes képi hibák és a felvétel során előálló rossz expozíció kiküszöbölhető. A létező szegmentációs eljárások közül egy statisztikai eljárást – a Fuzzy C-Means osztályozást – választottam, mivel ezzel a kép több jellemzője alapján végezhető el a szegmentálás. Ilyen jellemzők például az egyes képpontok adott környezetének szórása vagy a kép optimálisan kontrasztos szürkeskálás változata. Mivel az időben egymást követő képek, képkockák (ha videóként tekintünk a képsorozatra) nem térnek el nagymértékben, az előző képnél előálló szegmentációs eredmény is ilyen jellemzőnek tekinthető a következő képnél, mellyel jelentősen javítható a szegmentáció pontossága. A szegmentáció után az előálló szegmentált klaszterek jellemzőinek meghatározása a feladat. Erre és az előálló adatokból való statisztika előállítására a MATLAB környezet nagyon jó eszközöket biztosít. Ezekre építve egy olyan algoritmust készítettem, mely a rendelkezésre álló felvételekből értékelhető jellemzőket nyer ki, majd ezekből elkészíti a megfelelő statisztikákat.hu_HU
dc.description.courseProgramtervező-informatikushu_HU
dc.description.degreeMschu_HU
dc.format.extent26hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/129822
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjectképfeldolgozáshu_HU
dc.subjectszegmentációhu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Informatika::Komputergrafikahu_HU
dc.titleSejtklaszterek dinamikájának mérésehu_HU
Fájlok