A BACH1 transzkripciós represszor szerepének vizsgálata LPS-indukált egér csontvelő eredetű makrofágokban bioinformatikai módszerekkel
Absztrakt
Az őssejtekből kifejlődött makrofágok szövetspecifikus fenotípusaik létrehozásával kulcsfontosságú szerepet töltenek be a gyulladásos folyamatok kialakulásában és felszámolásában egyaránt, ugyanakkor a makrofág génszabályozás aktiváló és gátló folyamatainak elkülönítése nagy kihívást jelent és emellett a gátló hatásoknak csak nagyon kis hányada ismert. Jelen szakdolgozatom témáját a lipopoliszachariddal (LPS-sel) kezelt vad típusú és Bach1-deficiens csontvelő eredetű makrofág sejteken végzett RNS és ChIP szekvenálási adatok bioinformatikai alapelemzése és integrálása képezte.
Leírás
Kulcsszavak
csontvelő eredetű makrofág, BACH1 transzkripciós faktor, bioinformatika, RNS szekvenálás, ChIP szekvenálás