Stresszválasz gének duplikációs és deléciós eseményeinek vizsgálata Aspergillus gombákban
Absztrakt
A kutatásunk során azt vizsgáltuk, hogy a stresszválasz fehérjék ortológjainak száma, hogyan változott különféle Aspergillus fajokban és vajon mutatnak-e bármiféle konzervatívitást. Bemutatom azt az ortológiai vizsgálatot, amelyhez a megszekvenált, adatbázisból kigyűjtött Aspergillusokat vettünk alapul. Ezeken összehasonlítást végeztünk, hogy aztán az eredményeinkből meghatározhassuk a bekövetkezett evolúciós folyamatokat: deléciós és duplikációs eseményeket. Ezzel párhuzamosan, kiválasztottunk egy olyan enzimcsaládot, amelynek tagjai már a gombák közös ősében többször is duplikálódott, kialakítva több ortológ csoportot. Azon célból, hogy példával is alátámasszuk azt az elméletet, hogy a stresszben szereplő fehérjék megtalálhatóak az összes szekcióban (tehát nincs deléció) és nem jellemzőek a duplikációk.