A PAFB antifungális fehérje NMR szerkezetvizsgálata
Absztrakt
Az NMR módszerekkel megoldott fehérjeszerkezetek száma évek óta folyamatosan növekszik. Diplomamunkámban fő feladatom volt a PAFB fehérje NMR jelhozzárendelése. A PAFB szerkezetére egy jósolt modellt generáltam az I-TASSER webszerver alkalmazásával. A becsült szerkezetet összehasonlítottam az sfPAFB már ismert, számolt szerkezetével. Ezen felül a mért kémiai eltolódásokat felhasználva a fehérje oldószer kitettségét vizsgáltam a ShiftASA algoritmussal.
Leírás
Kulcsszavak
PAFB, fehérje, NMR, jelhozzárendelés