A Hypoxylaceae családhoz tartozó gombák [D1,2] típusú stwintronjainak in silico összehasonlító vizsgálata

Dátum
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

Az stwintron egy újonnan felfedezett genetikai struktúra, ezért célunk volt minél több példáját és jellemzőjét felderíteni. Elsőként egy szisztematikus bioinformatikai keresés során nyilvános fonalas gomba genom adatbázisokban kerestünk stwintronokat, majd esetleges manuális korrekciókat követően meglétüket kísérletesen is bizonyítani próbáltuk. Stratégiákat dolgoztunk ki az stwintronok kivágódási mechanizmusainak elemzésére, a belső intron konszenzus szekvenciáinak (donor, lariat, akceptor) irányított mutagenezise segítségével. Végezetül azt is megvizsgáltuk, hogy az egyik konkrét stwintron struktúrának van-e szerepe saját génjének a poszt-transzkripciós szabályozásában.

Leírás
Kulcsszavak
Hypoxylaceae, Hypoxylon, gomba, twintron, stwintron, in silico, genetika, bioinformatika, molekuláris genetika, genom
Forrás