A tavalyi évtől a Növény- és Talajvédelmi Szolgálat is integrálásra került a Mezőgazdasági Szakigazgatási Hivatalba, de alapfeladatai azonban nem változtak. A növények, növényi termékek, a talaj és egyéb növényi tápközegek hazai és nemzetközi forgalmával összefüggő külső és belső növényegészségügyi feladatok ellátásáért felelős. A növényvédőszerek forgalomba hozatalát, felhasználását vizsgálja valamint az engedélyek meglétét ellenőrzi. A termőföldek minőségének és termékenységének megóvását szolgáló szakigazgatási feladatok ellátásáért felelős. A növényvédelemmel, a talajvédelemmel, a tápanyag-gazdálkodással és a zöldség-gyümölcs minőségellenőrzéssel kapcsolatos feladatokat látja. A felszíni és felszín alatti vizek minőségi védelmével összefüggő növény- és talajvédelmi szakigazgatási feladatok irányításáért felelős. Növény- és talajvédelmi tájékoztatást nyújt a termelőknek. A szükséges növény-egészségügyi ellenőrzések végrehajtása, valamint a termék zárlati károsítóktól való mentességének igazolása minden esetben az illetékes MGSZH NTI feladata. Védett zónát jelölnek ki, ahol kérelmezőnek hivatalos ellenőrzési programot kell készítenie, amelynek igazolnia kell, hogy egy vagy több károsító, amelyekre az övezetet védett zónaként kívánják elismertetni, nem telepedett meg és ezt az MgSzH illetékes területi szervei bevonásával folyamatosan ellenőriznie kell.

Növényvédőszer, talajvédelemi feladatok, növényegészségügyi feladatok, MgSzH, zöldség-gyümölcs minőség ellenőrzés.