Baromfipatogén Pasteurella multocida és Riemerella anatipestifer nyomon követése molekuláris epidemiológiai módszerekkel

Kardos, Gábor Attila

Baromfipatogén Pasteurella multocida és Riemerella anatipestifer nyomon követése molekuláris epidemiológiai módszerekkel

dc.contributor.advisor	Kiss, István
dc.contributor.advisor	Gergely, Lajos
dc.contributor.author	Kardos, Gábor Attila
dc.contributor.department	Gyógyszertudományok doktori iskola	hu
dc.contributor.submitterdep	DE--OEC--Általános Orvostudományi Kar -- Orvosi Mikrobiológiai Intézet
dc.date.accessioned	2008-05-29T09:57:26Z
dc.date.available	2008-05-29T09:57:26Z
dc.date.created	2007	en
dc.date.defended	2007-11-09
dc.date.issued	2008-05-29T09:57:26Z
dc.description.abstract	Jelen munkában a modern molekuláris epidemiológia módszerek első alkalmazásáról számolok be a hazai állategészségügyi diagnosztikában. Két fontos baromfikórokozó baktérium, a Pasteurella multocida és a Riemerella anatipestifer vizsgálatát tűztük ki célul irodalomból adaptált és saját fejlesztésű módszerek segítségével. Az izolátumok azonosítását PCR alapú módszerekkel és rDNS szekvenálással erősítettük meg, a R. anatipestifer azonosítására alkalmas PCR módszert dolgoztunk ki. Az izolátumok genetikai rokonságának vizsgálatára különböző PCR-alapú (RAPD, rep-PCR) tipizáló módszereket és PFGE módszert vezettünk be, a R. anatipestifer tipizálására szolgáló PFGE módszer saját magunk dolgoztuk ki a P. multocida tipizálására alkalmas irodalmi módszer felhasználásával. A módszerek segítségével három baromfikolera járványsorozatot dolgoztunk fel retrospektív módon, illetve felmértük a hazai, kelet-magyarországi R. anatipestifer izolátumok genetikai diverzitását. Igazoltuk, hogy a három járványsorozat egy P. multocida törzs perzisztenciájára volt visszavezethető, a harmadik esetben a vakcina hatástalanságának okát is megvizsgáltuk. A módszerek valós időben (nem retrospektív módon) történő alkalmazása kulcsinformációt szolgáltathatott volna a járványsorozat jelentős részének megelőzéséhez, így a munka bemutatja a módszerek potenciális hasznosíthatóságát az állatorvosi diagnosztikában. A R. anatipestifer törzsekkel kapcsolatos eredmények alapján a törzsek eloszlása sem térben, sem időben nem volt homogén, tehát a kórokozó endémiás jelenlétét valószínűsítettük. A munka bemutatja a molekuláris tipizáló módszerek alkalmazhatóságát az állategészségügyi diagnosztikában, és modellként szolgálhat további állategészségüggyel kapcsolatos felhasználási területekhez. Így például a módszerek rendkívül hasznos információkat szolgáltathatnak a zoonózist okozó, valamint a bioterrorizmus szempontjából fontos baktériumok elleni megelőző/védekező eszközök kidolgozásához is. Ezek közül kiemelt fontosságúak az élelmiszer-biztonsághoz kapcsolódó vizsgálatok, ahol a bemutatottakhoz hasonlóan a fertőzés forrásának azonosításában és terjedésének felderítésében hasznosíthatóak ezek a módszerek. (Egy ilyen, a leggyakoribb Salmonella szerovariánsok és a termotoleráns Camyplobacter fajok farmtól a fogyasztóig történő nyomon követésére irányuló modellvizsgálat jelenleg is folyik.) ----- Present work reports the application of modern molecular epidemiology methods for typing of bacteria. The aim was to study two important fowl-pathogenic bacteria Pasteurella multocida and Riemerella anatipestifer using methods adapted from the literature as well as developed during the present work. Isolates were identified using specific PCR assays and rDNA sequencing, a PCR assay specific for R. anatipestifer was developed. To assess genetic relatedness of isolates different PCR-based (repetitive element based PCR, randomly amplified polymorphic DNA) typing methods and pulsed-field gel electrophoresis were applied, the pulsed-field gel electrophoresis protocol used for typing of R. anatipestifer was developed during this work on the basis of a protocol described to type P. multocida. We examined three series of fowl cholera outbreaks and investigated the genetic deiversity in a collection of Eastern-Hungarian R. anatipestifer isolates by means of the abovementioned method. We proved that all three outbreak series originated in the persistence of a P. multocida strain, in case of the third series we also examined the possible causes of the failure of the vaccine applied. By employing these methods in real time (in a non-retrospective manner) key information may have become available which could have been a powerful aid int he prevention of recurrences. The work represents a potential application of molecular epidemiology in veterinary diagnostics. Investigation of R. anatipestifer isolates revealed a spatially and temporally inhomogeneous pattern of strains, thus indicating the endemic presence of the pathogen in the area. Present work demostrates the applicability of molecular typing methods in veterinary diagnostic investigations, and may serve as a model to other application fields connected to veterinary sciences. These methods, for example, may provide useful data for the development of prevention programs against zoonotic bacteria or bacteria used as potential agents in bioterrorism. Food safety investigations bear emphasized importance in the EU, where these methods aid in microbial source tracking. (Such an investigation following Salmonellae and thermotolerant Campylobacter spp. From farm to fork is currently under way.	en
dc.format.extent	71 p.	en
dc.format.extent	386908 bytes
dc.format.extent	469086 bytes
dc.format.extent	18113 bytes
dc.format.extent	3068489 bytes
dc.format.extent	499712 bytes
dc.format.extent	500736 bytes
dc.format.extent	24064 bytes
dc.format.extent	6023680 bytes
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.format.mimetype	application/msword
dc.format.mimetype	application/msword
dc.format.mimetype	application/msword
dc.format.mimetype	application/msword
dc.identifier.opac	http://webpac.lib.unideb.hu:8082/WebPac/CorvinaWeb?action=cclfind&resultview=long&ccltext=idno+bibDEK00652431
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/2437/5328
dc.language.iso	hu	en
dc.language.iso	en	en
dc.subject	molekuláris epidemiológia	en
dc.subject	Rep-PCR	en
dc.subject	pulzáló mezejű gélelektroforézis	en
dc.subject	Pasteurella multocida	en
dc.subject	Riemerella anatipestifer	en
dc.subject	baromfikolera	en
dc.subject.discipline	Gyógyszertudományok	hu
dc.subject.dspace	DEENK Témalista::Orvostudomány::Orvosi mikrobilógia	hu
dc.subject.mesh	Epidemiology, Molecular	en
dc.subject.mesh	Pasteurella multocida	en
dc.subject.mesh	Pasteurella Infections -- veterinary	en
dc.subject.mesh	Poultry Diseaes -- epidemiology	en
dc.subject.mesh	Poultry Diseaes -- microbiology	en
dc.subject.mesh	Gram-Negative Bacteria	en
dc.subject.mesh	Gram-Negative Bacterial Infections	en
dc.subject.mesh	Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field	en
dc.subject.mesh	Polymerase Chain Reaction	en
dc.subject.sciencefield	Orvostudományok	hu
dc.title	Baromfipatogén Pasteurella multocida és Riemerella anatipestifer nyomon követése molekuláris epidemiológiai módszerekkel	en
dc.title.translated	Fingerprinting of Fowl Pathogenic Pasteurella Multocida and Riemerella Anatipestifer with Molecular Epidemiology Methods	en