A SETMAR DNS transzpozon kapcsolata a kromatin szerkezetével: bioinformatikai és genomikai analízis
Betöltés ...
Dátum
Authors
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
DOI
Absztrakt
Munkánk célja volt a SETMAR fehérje kötődési helyeinek annotálása a humán genomban. A kísérletet humán haploid leukémia sejteken (HAP1) végeztük, melynek során kromatin immunoprecipitáció (ChIP) segítségével specifikusan feldúsítottuk a SETMAR-kötött DNS szakaszokat majd Illumina szekvenálással meghatároztuk a SETMAR kapcsolódási helyeit a humán genomban. Elvégeztük az NGS olvasatok illesztését a hg38 referencia genomra, majd beazonosítottuk a fúziós fehérje kapcsolódási helyeit.