A holtmedrek üledék-kémiai vizsgálata során számos, a holtmederre hatással lévő esemény eredetét tudjuk kivizsgálni. Az üledékek monitorozása igen fontos, mivel az üledékben kimutatható anyagok koncentrációja pontos képet ad a holtmedret érő szennyezésekről, antropogén hatásokról és segíti az élőhely környezeti állapotának felmérését. A rakamazi Nagy-morotva üledékének vizsgálata során évszakos elkülönülést tapasztaltunk az üledékek összetétele alapján. A meder egyes részein,adott évszakon belül részleges különbségeket figyeltünk meg az üledék-kémiai összetételek alapján, elsősorban a vízi növényzettel borított területek és a nyílt vízi területek között.