Egr2-hiányos alveoláris makrofágok genomikai és epigenomikai karakterizálása bioinformatikai módszerekkel

Dátum
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

Kutatásunk során a tüdőszövet speciális immunsejtjeit, az alveoláris makrofágokat vizsgáltuk, melyek a tüdő számára védelmet nyújtanak a fertőző ágensekkel szemben. Ezen makrofágokban karakterizáltuk az Egr2 (Early Growth Response 2) gén és az erről átíródó EGR2 transzkripciós faktor szerepét a genomban bioinformatikai módszerekkel. Az RNS szekvenálási adatok, az ATAC szekvenálási adatok, illetve ezek integrálása révén pedig következtettünk a fehérjemennyiségre, valamint tanulmányoztuk a kromatin-állomány nyitottságát is.

Leírás
Kulcsszavak
alveoláris makrofág, EGR2 transzkripciós faktor, bioinformatika, RNS szekvenálás, ATAC szekvenálás
Forrás