Sejtszegmentálás és sejtkövetés mikroszkópikus felvételeken

Dátum
Szerzők
Kovács, Kornél János
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

A képfeldolgozás fejlődése lehetővé teszi, hogy egyre gyorsabb és precízebb sejtekkel kapcsolatos kutatásokat lehessen végezni. Ennek révén a dolgozat egy szoftver fejlesztését írja le, amely célja gyógyszer kutatási folyamatok automatizálása. Az elkészült szoftver egyszerűen kezelhető, könnyen tanulható. A felhasználói felület C# programnyelven készült, amelyen keresztül a felhasználó interakcióba léphet a programmal. A képfeldolgozási folyamatokat végző programok Python nyelven készültek. A program lehetőséget ad arra, hogy a felhasználó megnyisson benne .czi kiterjesztésű mikroszkopikus felvételeket, amelyeket utána szegmentálhat, vagy .png kiterjesztésű szegmentált képeket, amelyeken elemzés végezhető el. A sejtek szegmentálásához a felhasználó a külső fejlesztésű Napari programot használhatja fel, amelyet a diplomamunka során megírt programon keresztül lehet elindítani. A szegmentált képen végrehajthatóak számítások, melyek kiszámolják az azon lévő sejtekhez tartozó átlag intenzitás értékekből vett arányszámokat. A végeredmények egy felugró ablakban jelennek meg, amelyeken láthatóak a számításokkor felhasznált sejtek felcímkézve sorszámmal, valamint egy táblázat, amely az arányszámokat tartalmazza. Ezeket felhasználva a megfelelő szaktudással rendelkező gyógyszer kutatók elemezni tudják a sejteken végrehajtott gyógyszeres kezelések eredményességét.

Leírás
Kulcsszavak
képfeldolgozás, sejtszegmentálás, szoftverfejlesztés, sejtkövetés, python, C#
Forrás