Kereskedelmi forgalomban kapható élesztőtörzsek molekuláris filogenetikai elemzése

Abstract

A szakdolgozatom fő témája a kereskedelmi forgalomban kapható élesztőtörzsek, illetve a molekuláris filogenetikai elemzésük. A dolgozat megírása során 5 gén, illetve genomi régió (CCA1, CYT1, HMX1, ITS, NUP116) esetén végeztem el szekvencia illesztést és filogenetikai elemzést. A szekvencia elemzésekkel célom volt, hogy a hazai kereskedelmi forgalomban kapható élesztőminták egyes génjeit összehasonlítsam más, már a GenBank adatbázisban BLAST-keresés alapján fellelhető élesztőszekvenciákkal, majd ezután többszörös illesztést végezzek, végezetül az illesztés alapján filogenetikai dendrogramot készítsek Maximum Likelihood módszerrel. Valamennyi esetben azt tapasztaltam, hogy a faj esetében már leírt kládok nem, vagy alig voltak megfigyelhetőek a törzsfákon ennek oka az lehet, hogy a családokat teljes genom elemzés alapján határozták meg. Az élesztő fertőzések eredetének meghatározásához egyértelműen teljes genom szekvenálás szükségeltetik.