Spliceoszómális iker-intron struktúrák a Hypoxylaceae családban

Abstract

A diplomamunkám témája a korábban Hypoxylon sp. CO27-5 genomjában megtalált, összetett stwintron struktúrák 15 tagjának összehasonlító elemzése és statisztikai analízise volt, ami tartalmazza a többszörös szekvenciaillesztést, a másodlagos szerkezetek, és a hozzájuk tartozó legkisebb szabad energiaszintek meghatározását, valamint az intron szimmetria és a fajok közti megjelenés szemléltetését. A nem-sister stwintron ortológok elterjedése sokrétűbb, mint a sistereké, valamint a sister stwintronok ortológjai csak a közeli rokonságban álló EC38 genomban fordultak elő. Minden stwintron szimmetrikus, a sister stwintron szekvenciák között magas a hasonlóság. A stwintronok által felvett struktúrák nagyon változatosak, a sister stwintron másodlagos szerkezetek minimum energiaszintje sokkal alacsonyabb a nem-sistereknél, ami a különbségekre utal a szerkezetek stabilitásában. A legtöbb stwintron első fázisban található a kodon első és második nukleotidja között, a stwintronok külső intronjai átlagosan hosszabbak a belső intronoknál.