A Cymbidium gyűrűsfoltosság vírus által indukált géncsendesítés

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorBorbély, György
dc.contributor.authorÓnodi, Szilárd
dc.contributor.departmentDE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai Intézethu_HU
dc.date.accessioned2009-12-07T12:59:17Z
dc.date.available2009-12-07T12:59:17Z
dc.date.created2009
dc.date.issued2009-12-07T12:59:17Z
dc.description.abstractA poszttranszkripcionális géncsendesítés (PTGS) egy ősi eukarióta mechanizmus, amely az evolúció során a parazita nukleinsavak, így a viroidok, vírusok és a transzpozonok ellen alakult ki. Ez a folyamat egyaránt működik növényekben és állatokban, feltehetően már a közös egysejtű ős is rendelkezett ezzel a védelmi eszközzel. A PTGS során a citoplazmában homológia-függő RNS lebontás történik, mely az indukáló dupla szálú RNS (ds RNS) molekulát\és a hozzá hasonló egyszálú RNS-eket érinti. A folyamatot kis molekulasúlyú (21-25 nt), szekvencia-specifikus RNS-ek megjelenése kíséri. Ezen kis RNS-eket kimutatva munkacsoportunknak sikerült egy olyan vírus (Cymbidium gyűrűsfoltosság vírus, CymRSV) esetében is igazolni a PTGS-t, amely nem a citoplazmában, hanem a peroxiszómában replikálódik. Úgy tűnik, hogy a sejtorganellumban történő replikáció nem hatékony módja a PTGS elkerülésének. Kísérleteink során a molekuláris biológia széles eszköztárát felhasználtuk a klónozástól a hibridizációs technikákon át az in vitro transzkripcióig. Vizsgálatink kiderítették, hogy a (CymRSV) által Nicotiana benthamiana növényben indukált PTGS során nemcsak a vírusgenom teljes hosszáról, hanem annak egy darabjáról, nevezetesen a köpeny fehérjét kódoló RNS szakaszról is képződnek kis RNS-ek. Mind a "sense", mind pedig az "antisense" próbával ki tudtuk mutatni a vírus-specifikus kis RNS-eket. A PTGS során keletkező kis RNS-eket (20-25 bp) , jelöltük és a vírus PCR-rel amplifikált 400-bp-os darabjaihoz hibridizáltuk. Megállapítottuk, hogy a kis RNS-ek keletkezése nem egyöntetű a CymRSV genomról. Vannak kitüntetett régiók, melyektől nagyobb arányban keletkeztek kis RNS-ek és vannak kevésbé kitüntetett régiói az RNS genomok a PTGS-nek. Így elképzelhető, hogy a kis RNS képzésben a vírusreplikáció során keletkei) intermedier ds RNS forma mellett a vírus erős (dupla szálú) másodlagos szerkezete is szerepet játszik. Meghatároztuk, hogy a CymRSV indukálta PTGS során keletkező kis RNS-ek többsége ds RNS formában van jelen a nővényben. A PTGS mechanizmusára vonatkozó modellt kiegészítettük a kísérleti eredményeinkkel. A PTGS-t indukáló molekulák jellemzése, a folyamat során keletkező mediátor és szignál molekulák, valamint a mechanizmusban szerepet játszó gének azonosítása által a gazda-vírus kapcsolat eddig rejtett kölcsönhatásai is feltárhatók. Egyre bővülő ismereteink így lehetőséget adhatnak az eddigieknél hatékonyabb vírus ellenálló növények előállítására. A PTGS mélyebb megismerése azért is fontos, mert a folyamat szerepet játszhat az endogén gének szabályozásában is.hu_HU
dc.description.correctorgj
dc.description.courseBiológiatanárhu_HU
dc.description.degreerégi képzéshu_HU
dc.format.extent65hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/90683
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjectgéncsendesítéshu_HU
dc.subjectvírushu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Biotechnológiahu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Molekuláris biológiahu_HU
dc.titleA Cymbidium gyűrűsfoltosság vírus által indukált géncsendesítéshu_HU
Fájlok
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Természettudományi és Technológiai Kar)