A Kárpát-medencében izolált Macrophomina phaseolina morfológiai és molekuláris azonosítása ITS1-ITS4 primerekkel
Dátum
Authors
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
DOI
Absztrakt
A diplomadolgozatom fő témája a Kárpát-medence különböző területeiről gyűjtött Macrophomina phaseolina, növénypatogén kórokozóból származó izolátumok genetikai azonosítása ITS1-ITS4 primerekkel, valamint a közöttük lévő rokonsági kapcsolat vizsgálata és összevetése az NCBI adatbázisában lévő szekvenicákkal. A kutatás során izolált mintákból egy törzsfát hoztam létre, amely meghatározza az izolátumok közötti genetikai különbséget. A vizsgálat során morfológiai azonosítást is végeztem, mely során megállapítottam a kórokozó által termelt mikroszkleróciumok átmérőjét. Az eredmények azt mutatták, hogy az ITS szekveciára alapozott szekvenálást ki kell egészíteni további primerpárral a megfelelő faji szintű azonosításhoz. Továbbá arra is következtettem, hogy a kórokozót nem lehet földrajzilag eltérő régiókba csoportosítani, mivel a vizsgált izolátumok földrajzi elhelyezkedése távol esik egymástól, mégsem tudtam kimutatni eltérést közöttük.