Fonalas gomba növekedésének mérése time-lapse felvételeken

Dátum
Szerzők
Mátyás, Anita
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

A Candida albicans gomba jelenléte az emberi szervezetben természetes, azonban a túlzott elszaporodása nyomán többféle betegség is kialakulhat. Bár a patikákban már számos kenőcs és gyógyszer kapható, az orvostudomány továbbra is nagy hangsúlyt fektet hatékonyabb szerek létrehozására. A Debreceni Egyetem Mikrobiális Biotechnológiai Tanszékének laborjában kialakított perfúziós rendszer lehetővé teszi a sejttenyészetek hosszú távú, in vitro megfigyelését. A megfigyelés közben készített time-lapse felvételek alapján pedig lehetővé válik a hatóanyagok sejttelepekre gyakorolt hatásának objektív elemzése. A felvételek kiértékelése korábban manuálisan vagy fél-automatikusan történt, mely egyrészt időigényes volt, másrészt a kapott eredmény függött az elemzést végző személy egyes döntéseitől. A kutatás során egy olyan módszert dolgoztunk ki, mely alkalmas a fonalas gombákról készült felvételek hatékony elemzésére, a gombák növekedésének mérésére. Az algoritmust C++ nyelven implementáltam, az OpenCV függvénykönyvtár felhasználásával. A program által szolgáltatott eredmények kiértékeléséhez két, KO mutáns Candida albicans fonalas gombákról készült felvételsorozatot használtam. A gombadetektáló program által adott eredményt a felvételekről készült két kézi annotációval vetettem össze. Az eredmények alapján elmondható, hogy a kifejlesztett szoftver alkalmas a gombatelepek növekedésének mérésére, ami elősegíti a különféle szerek hatásának gyors és objektív kiértékelését.

Leírás
Kulcsszavak
képfeldolgozás, time-lapse mikroszkópia, fonalas gomba
Forrás