A környezetvédelem egyik legfontosabb része a vizek védelme. Ennek érdekében gondoskodnunk kell a szennyvizek biztonságos összegyűjtéséről, elvezetéséről és tisztításáról. A Debreceni szennyvíztisztító telepre naponta 30-50 ezer köbméter szennyvíz kerül, amit mechanika, kémiai és biológiai módszerek kombinációjával tisztítanak. Ennek eredménye a tisztított szennyvíz,amiben a szennyező anyagok megengedett mennyiségét a 28/2004. (XII. 25.) KvVM rendelet szabályozza. A tisztítási folyamat másik eredménye a szennyvíziszap. Az iszap szerves- és tápanyagokban gazdag, így a mezőgazdaság hosszú távon fenntartható módon számos célra tudná használni. A szennyvíziszapok és a szennyvíziszap komposztok mezőgazdasági felhasználhatóságát az 50/2001 (IV. 3.) Korm. rendelet szabályozza.