Az antibiotikum rezisztencia napjainkra komoly problémává nőtte ki magát, ezért az antibiotikumok hatáscsökkenése szükségessé teheti olyan alternatív terápiák alkalmazását, melyek vagy az antibiotikumokkal kombinációban, vagy azok nélkül képes a bakteriális eredetű fertőzések leküzdésére. Alternatív terápiás eljárásként alkalmazható lehet a lítikus bakteriofágokat alkalmazó fágterápia, melyhez kapcsolódóan célunk a multirezisztens Escherichia coli izolátumok ellen hatékony bakteriofágok izolálása, illetve az izoláló baktériumok és bakteriofágok jellemzése volt. Kutatásunkhoz 31 szennyvízminta, illetve 8 különböző E. coli törzs állt rendelkezésünkre, amelyekből a megvizsgáltuk az izolált bakteriofágok hatékonyságát, illetve új-generációs szekvenálási módszerekkel jellemeztük a különböző E. coli törzseket. A baktériumok genomjának szekvenálásakor számos antibiotikum rezisztencia gén és profág hordozását figyeltük meg a bakteriális genomban. Az E. coli törzsek között találtunk pandémiás humán patogén ST131 szekvencia típusú törzseket, valamint egy, a mára szintén pandémiássá vált ST1193 szekvencia típusba tartozó törzset. A 8 törzsből 6 ellen izoláltunk bakteriofágokat (n=167), melyek között ugyan kis számban, de volt olyan bakteriofág, amelyek gazdatörzsükön kívül 5 másik törzzsel szemben (4%; n=7/167) bizonyultak hatékonynak, klonális csoporttól és szekvencia típustól függetlenül. A baktériumokban észlelt nagyfokú rezisztencia az antibiotikumokkal szemben szükségessé teheti a bakteriofág terápia alkalmazását. A pandémiás humán patogén klonális csoportba tartozó törzsekkel szemben hatékony fágok alkalmazása hasznos módszer lehet a multirezisztens kórokozók által okozott fertőzések kezelésére, ám az izolált fágok további jellemzése szükséges a biztonságos használathoz.