A szőlőültetvényeket világszerte veszélyeztető probléma napjainkban a GTD (grapevine trunk diseases), azaz fertőző tőkeelhalást okozó betegségkomplexumok. A kórokozók által jelentős gazdasági kár keletkezhet, mert a terméskiesésen túl, akár a növény teljes elhalását is okozhatják. Az évenként növekvő tőkehiány az ültetvény idő előtti ökonómiai elöregedéséhez vezet. A védekezés módja még nem megoldott a GTD kórokozókkal szemben, mert nem teljesen ismert az azt okozó patogének pontos fajösszetétele, életmódja, terjedése és egymás közötti kapcsolatai. A betegség ellen a megelőzés a leghatékonyabb eszköz, amely magába foglalja a higiéniai szabályok betartását és a megfelelő művelési mód megválasztását is. A GTD 2019-es epidemiológiai felmérésekor 11 ültetvényből, 6 borvidék területéről gyűjtöttünk faszöveti mintákat. Ezekből később izoláltuk az endofiton fonalas gombákat majd telepmorfológiai és molekuláris módszerrel, az ITS 1-4 régió szekvenciaanalízisével azonosítottuk azokat. A meghatározott fajokat törzsfenntartásra, egy génbank létrehozására használjuk fel, amelyek a további vizsgálatokhoz szükségesek. Az eredmények azt mutatják, hogy a GTD patogének az összes vizsgált ültetvényben jelen vannak. Az azonosított gombák közül a GTD kórokozókon túl számos szaprofita faj került ki, többek közt olyan fertőző endofiton faj is, mint a Truncatella angustata, amelyet korábban hazánkban még nem írtak le szőlőről. Ezen túl találtunk olyan potenciális biológiai védekezésre alkalmas endofiton gombafajokat is, mint a Clonostachys rosea, az Epicoccum nigrum és a Fusarium sp..