A PA-IL lektin és tio-digalaktozid ligandumok kölcsönhatás vizsgálata mágneses magrezonancia (NMR) módszerek segítségével
Fájlok
Dátum
Authors
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
DOI
Absztrakt
A diplomamunkám célja a Pseudomonas aeruginosa baktérium fertőzésében kulcsszerepet játszó LecA fehérje és új, potenciális inhibitorok közötti kölcsönhatások vizsgálata, valamint a mérési folyamat optimalizálása volt. A kutatás során modern NMR-technikákkal, köztük egy újszerű 1H-13C HSQC-CLIP-COSY módszerrel végeztem el a vizsgált ligandumok pontos jelhozzárendelését és szerkezetigazolását. Ezt követően a kötődési affinitás meghatározásához a hagyományos 1H-alapú STD NMR méréseket hasonlítottam össze a korszerűbb 19F CPMG NMR módszerrel. Az eredmények rávilágítottak, hogy a 19F-NMR alkalmazása nemcsak az egyszerűbb kiértékelést teszi lehetővé, hanem jelentős műszeridő megtakarítást is eredményez a rutinszerű mérésekhez képest. A munkánk során kidolgozott kompetíciós mérési protokoll segítségével fluort nem tartalmazó molekulák kötődését is hatékonyan megtudtuk határozni. Az optimalizált eljárás így gyors és költséghatékony megoldást kínál a jövőbeni gyógyszerjelölt vegyületek nagy áteresztőképességű szűréséhez.