A természetes (veleszületett) immunitás a szervezet védelmének legősibb formája. A rendszer elemei genetikailag kódolt mintázatfelismerő receptorokat (szakmai nyelven rövidítve: PRR) használnak a patogén-asszociált molekuláris mintázatok (szaknyelvi rövidítésük összefoglalóan: PAMP) felismerésére, melyek olyan evolúciósan konzervált testidegen mintázatok, melyeket mikróbák nagy csoportjai fejeznek ki. A parodontitis egyik legjellemzőbb karakterisztikája a gyulladt szövetek erőteljes neutrofil infiltrációja. A gyulladást legjellemzőbb módon a szöveti rezidens makrofágok és dendritikus sejtek PRR-mediált aktivációja okozza. A parodontitis jövőbeli kezelésének egyik legfontosabb farmakológiai stratégiája nem pusztán a gyulladás gátlására épül, de azon molekuláris immunológiai mechanizmusok megértésére is, melyek drasztikus módon meghatározzák a szájüregi immunkontrollt és annak az orális-mikrobiális homeosztázisban betöltött alapvető szerepét.