A plazmidok jelentősége mára bizonyított mind az orvosi, mind a különböző biológiai célból történő alkalmazások során, ahol a plazmid biológiai vektorként használva, különböző géneket, illetve gén szakaszokat képes célzottan a sejtekbe juttatni, melyek végül akár be is épülhetnek a gazdasejt saját DNS-ébe. Ezek alapján, azt már tudjuk, hogy mi az eredménye annak, ha egy plazmid bejut a sejtbe, de arról még nem rendelkezünk elegendő információval, hogy pontosan mi történik vele, ha bekerül a sejtmagba.A rendelkezésemre álló egér, illetve emberi sejtmagba juttatott plazmid szekvenálási eredmények lehetővé tették, hogy a dolgozatomban ismertetett bioinformatikai módszerekkel és programokkal összeállíthassam a mintákban előforduló plazmid szekvenciákat, kimutatva ezzel a jelenlétüket, illetve a különböző fehérjék általi hozzáférhetőségüket (ATAC-seq).