Time-lapse imaging képszekvenciák digitális analízise a sejtciklus szinkronizáció vizsgálatában

Dátum
2013-05-10T08:22:42Z
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

Vizsgálataim során a sejtciklus szinkronizáció hatásait tanulmányoztam digitális analízissel HaCat (humán keratinocita /emberi bőrsejtek) tenyészetén belül. A méréseim a sejtek számán bekövetkező változásokra, az osztódó sejtek számának változásaira és az osztódások időtartamának különbségeire terjedt ki. Digitális analízis alatt képszekvenciák elemzését értjük, olyan szoftver alkalmazásával, amely matematikai algoritmusok segítségével kvantitatív és kvalitatív információkat tud kinyerni azokból. A képszekvenciák létrejöttét Long-Term Scan rendszer tette lehetővé Time-lapse imaging módszert alkalmazva. A folyamat során meghatározott időközönként készíthetünk felvételt a vizsgálni kívánt tenyészetről. Ennek segítségével szerzünk több információt a sejtpopulációk életfolyamatairól több sejtciklus alatt. A felvételeket a Fiji nevű, nyílt forráskódú képelemző programmal tanulmányoztam, amely számos funkcióval rendelkezik, képjavító és képelemző lehetőségeket is beleértve. Használata során a „treshold” technikát alkalmaztam az előtér és háttér elválasztására, amelyből bináris kép nyerhető ki, ez szolgál a szinkron tenyészet képi információjának kinyerésére. A sejtciklus szinkronizáció abból áll, hogy a tenyészettől először megvonjuk a szérumot, amely szükséges a sejtek életfolyamataihoz. Egy idő után a sejtek osztódása jelentősen lecsökken, vagy teljesen meg is szűnhet (sejtpopuláció típusától függően). Csak ekkor biztosítjuk újra a tenyészet számára a szérumot, ami a sejtek egyidejű osztódását fogja eredményezni. Ezt szinkron tenyészetnek nevezzük. Ha a sejtek a sejtciklus különböző fázisaiban vannak, azt aszinkron tenyészetnek nevezzük. Mindezekből az alábbi konklúziókra jutottam: a szérum megvonása HaCat tenyészetben az osztódások számának csökkenését és az osztódási idő megnyúlását eredményezi. Ennek magyarázata az, hogy a szérum (FBS: fatal bovine serum) a sejtciklus G1 szakaszában fejti ki hatását, annak időtartam rövidülését okozza, ezzel a sejteket újabb (és gyorsabb) osztódásra késztetve.

Leírás
Kulcsszavak
LTS, HaCat, sejtciklus szinkronizáció, Time-lapse imaging
Forrás