Szekvenálási módszer optimalizálása égési sérültek mikrobiom változásának vizsgálatára

Abstract

A súlyos égési sérülések (20% feletti testfelület esetén) szisztémás gyulladást és oxidatív stresszt váltanak ki, amely a bélmikrobiom egyensúlyának felborulásához, diszbiózishoz vezet. Kutatásunk célja a 16S szekvenálási módszer optimalizálása volt a bélmikrobiom-változások vizsgálatához. Hét betegtől származó mintákon DNS izolálást, PCR-t és szekvenálást végeztünk, majd a taxonokat azonosítottuk. Az eredmények jelentős szórást mutattak, de a módszer ismételhetősége és megbízhatósága igazolódott. A leggyakoribb baktériumnemzetségek a Bacteroides és a Blautia voltak.