Korszerű NMR módszerek alkalmazása egy biológiailag aktív peptid toxin szerkezetvizsgálatára
Absztrakt
A szakdolgozatom témája az sCm39, ami a Centruroides margaritatus-ból izolált 37 aminosavból álló peptid toxin szerkezetvizsgálata. A skorpiók mérgeiből származó egyes toxinok gátló funkciót töltenek be a Kv1.3 csatornán, ebből adódóan a Kv1.3 vonzó farmakológiai célponttá vált számos T-sejt-mediált autoimmun betegség kezelésében. A különböző állati toxinok szerkezetének és funkcióinak felderítése számos érdekes kutatási lehetőséget kínál a „fehérjemérnökség” tekintetében. Mielőtt a Cm39 peptid szerkezetét tanulmányoztam volna, egy 10 aminosavból álló modellpeptid vizsgálatát is elvégeztem. A molekulák szerkezetvizsgálatára NMR spektroszkópiai módszereket alkalmaztam, a két peptidről 1D és különböző 2D homonukleáris, illetve heteronukleáris spektrumokat rögzítettünk. Célul tűztem ki a kapott spektrumok alapján történő teljes 1H, 13C, 15N jelhozzárendelés elvégzését és az aminosavszekvencia igazolását, amihez a CCPNmr AnalysisAssign programot alkalmaztam.