A csípőszúnyogok között vannak olyan fajcsoportok (Anopheles maculipennis fajcsoport és Culex pipiens fajcsoport), melyeken belül a fajok és alfajok identifikálása külső morfológiai bélyegek felhasználásával nehéz. A problémát tovább nehezíti, hogy az identifikációban igen nagy jelentőségűek a testet és szárnyakat borító pikkelyek. Ezek viszont már az állat élete során is annyira lekophatnak, hogy szinte lehetetlenné válik az azonosításuk. Újabban vannak törekvések, hogy ezt a problémát morfometriai vizsgálatok réven próbálják mérsékelni.