DisperzinB enzim alhely térképének meghatározása

Abstract

A baktériumok és más mikroorganizmusok biofilmekbe tömörülve kötődnek meg különböző felületeken. A biofilmekben a baktériumok egy extracelluláris mátrixban védetten találhatóak. A biofilmek hasznos felhasználási területei a szennyvíz és légtisztítás, viszont az orvostudomány számára sok problémát vetnek fel. Az emberi szervezetben kialakuló biofilmek komoly megbetegedéseket okoznak azáltal, hogy a szervezet nem képes ellenük megfelelően védekezni és az antibiotikumok is kevésbé hatásosak ellenük. Így biofilm alakulhat ki a fogakon, és a szervezetbe beültetett különböző eszközök felszínén. Az Aa. által termelt DspB enzim ezt a biofilm extracelluláris mátrixát felépítő poliszacharidot bontja, és ezzel a biofilmek eltávolításában játszik szerepet. Az enzim a GlcNAc egységeket β(1,6)-os kötésben tartalmazó poliszacharidot bontja. Ezen tulajdonságai alapján az enzim széles spektrumú antibiofilm ágensként való felhasználásra látszik alkalmasnak. Dolgozatomban a vad típusú DspB és egy aktív hely mutánsa az Y187A kinetikai összehasonlítását és alhely térkép számítását végeztem el.