Polimerek kölcsönhatása az androgén receptorral

Abstract

A jelen szakdolgozat a környezetben felhalmozódó és az emberi szervezetbe elkerülhetetlenül bejutó nanoműanyagok potenciális egészségkárosító, különösképpen endokrin diszruptor hatásait vizsgálja, fókuszálva az androgén receptor ligandkötő domainjével (AR) kialakított molekuláris szintű kölcsönhatásaikra. A kutatás során öt kiemelten fontos polimer – a poliamid 6,6 (N66), a polietilén (PE), a polipropilén (PP), a polisztirol (PS) és a poliuretán (PUR) – dinamikai viselkedését és kötődését elemeztem molekuladinamikai (MD) szimulációk segítségével, GROMACS és VMD szoftverkörnyezetben. A dokkolási folyamat és a konformációs tér feltérképezése érdekében Simulated Annealing (SA) eljárást alkalmaztam, amelynek során egy egységes és egy polimerspecifikus hűtési protokoll hatékonyságát hasonlítottam össze hat különböző térbeli irányból indítva a láncokat.