Fehérjeinterakciós hálózatok vizsgálata különböző kórképekben

Abstract

A dolgozatomban proteomikai adatokból építettem fel fehérje-fehérje interakciós hálózatokat három csoport (control, obese, diabetes) összehasonlító vizsgálatára. A módszertan implementálását Python nyelv segítségével végeztem, felépítettem egy reprodukálható adatfeldolgozási pipelinet. A pipeline magába foglalja az adatok tisztítását, a hálózatok felépítését, különböző gráfmetrikai, és kapcsolatstatisztikai elemzéseket. A kiszámított eredményeket csoportonként összehasonlítottam, majd statisztikai korrekcióval igazoltam a szignifikanciájukat. Az eredmények alapján több biológiailag releváns interakciós különbséget sikerült azonosítanom a csoportok között. A kapott hálózatokat és az eredményket Cytoscape szoftver segítségével vizualizáltam.