Fogorvostudományi Doktori Iskola

Állandó link (URI) ehhez a gyűjteményhez

https://hdl.handle.net/2437/101848

Általános Orvostudományi Kar

Fogorvostudományi Doktori Iskola
(vezető: Dr. Nánási Péter)

tudományág:
- klinikai orvostudományok

Böngészés

Fogorvostudományi Doktori Iskola Szerző szerinti böngészés "Dánielné Sándor, Katalin"

Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
  • Nincs kép
    TételSzabadon hozzáférhető
    Transcriptional control of transglutaminase 2 expression in mouse apoptotic thymocytes
    Dánielné Sándor, Katalin; Szondy, Zsuzsa; Sándor, Katalin; Fogorvostudományi doktori iskola; DE--Általános Orvostudományi Kar -- Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet
    Az apoptózis egy fiziológiás folyamat, kritikus a feleslegessé vált, vagy veszélyt jelentő sejtek eliminálásában. Nap mint nap több milliárd sejt hal el apoptózissal és takarítódik el a professzionális fagociták által, anélkül, hogy gyulladás alakulna ki. A sejthalál program egyik fontos résztvevője a transzglutamináz 2 (TGM2), amely egy multifunkcionális enzim, kritikus szerepet játszik az apoptótikus sejtek megfelelő felismerésében, eltakarításában, továbbá megakadályozza a gyulladáskeltő sejttartalom kijutását. Az enzim kifejetődése erősen megnövekszik a T-sejtek apoptózisa során a tímuszban. Az egér tímusz apoptótikusan meglehetősen aktív, mivel a sejtek több mint 90%-a elhal érésük és differen-ciálódásuk során. Emiatt az egér tímusz eredetű apoptótikus timociták kiváló modellrend-szert nyújtanak a TGM2 enzim szabályozásának tanulmányozásához olyan molekulák részvételével, amelyek jelen vannak a timikus környezetben in vivo. A disszertáció első részében azt vizsgáltam, hogy a tímuszban jelen lévő, makrofágok által szekretált molekulák, mint például a TGFβ, adenozin és retinoidok hogyan járulnak hozzá a TGM2 kifejeződéséhez génexpressziós szinten. Azt találtuk, hogy az adenozin együttműkö-dik a TGFβ és a retinsav által aktivált jelátviteli utakkal, ezáltal szignifikánsan növeli a Tgm2 gén kifejeződését az elhaló timocitákban in vitro. Továbbá, az adenozin az adenozin A2A recetor – adenilát cikláz útvonalon keresztül fejti ki hatását, hozzájárul a TGM2 gén és fehérje szintű kifejeződéséhez in vivo. Azt is megmutattuk, hogy az adenozin exrtacellulárisan keletkezik az apoptótikus timociták eltakarítása során, részben adenin nukleotidokból, amelyek a pannexin-1 csatornákon keresztül jutnak ki, mely egy újfajta együttműködésre világít rá a makrofágok és az apoptótikus sejtek között. A munkám második részében bemutattam, hogy a tímuszban jelenlévő mediátorok hogyan regulálják a Tgm2 gén kifejeződését különböző intergenikus regulátor elemeken. Az intergenikus szabályozó elemek szerepe eddig tisztzatlan volt a Tgm2 esetében a timocitákban. Hogy túllépjünk a technikai korlátokon, az ENCODE konzorcium által gene-rált teljes genom szintű ChIP-seq és DNase-seq adatokat használtunk, melyek kombinálásá-val feltártuk a gén lehetséges regulátor elemeit illetve enhanszer-specifikus RNS transzkriptek (eRNS) mérésével azonosítottuk azokat, amelyek funkcionálisan fontosak lehetnek a gén regulációja szempontjából. Munkánk egy újfajta stratégiát nyújt arra, hogyan azonosítsuk és karakterizáljuk egy gén szignál specifikus, funkcionális enhanszer készletét, teljes genom szintű adatokat használva és eRNS moleulák produkcióját mérve.