Szerző szerinti böngészés "Kocsis, Beatrix"
Megjelenítve 1 - 9 (Összesen 9)
Találat egy oldalon
Rendezési lehetőségek
Tétel Embargó alatt A (delta)BbatfA deléciós mutáns előállítása és vizsgálata Beauveria bassianabanTorma, Bianka Noémi; Leiter , Éva Julianna; Kocsis, Beatrix; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA (delta)BbatfA deléciós mutáns előállítása és vizsgálata Beauveria bassianaban. B. bassiana rovarpatogén gomba mutánsok előállítása S. pombe Atf1 ortológ BbatfA-t kódoló géndeléciós mutáns , A. tumefaciens mediálta transzformálással. Majd oxidatív stresszkísérleteknek vetettük alá a mutánsokat,melynél kiderül MSB-re való érzékenysége. További kutatások még folyni fognak a közeljövőben ezzel a géndeléciós mutánssal és egyéb patogén fajokkal.Tétel Embargó alatt A Beauveria bassiana rovarpatogén gomba ΔBbatfA mutánsának stresszvizsgálataiStankovics, Huba; Kocsis, Beatrix; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetAz alábbi Szakdolgozatban a Beauveria bassiana rovarpatogén gombát vizsgáltuk. Annak bZIP típusú transzkripciós faktorát kódoló atfA gén funkciójának tanulmányozása érdekében megvizsgáltuk a deléciós mutáns különböző stresszekkel szembeni érzékenységét. Elkészítettük a ΔBbatfA deléciós mutánst B. bassiana-ban Double-Joint PCR módszerrel. Ezután A B. bassiana transzformálása tortént meg A.tumefaciens-szel. Ezután következhetett az előállított és genotípus teszt alapján megfelelő mutáns stresszérzékenységének vizsgálatát oxidatív, ozmotikus, sejtfalintegritás, nehézfém és nitrózatív stresszel szemben.Tétel Szabadon hozzáférhető Az AtfA és AtfB bZIP típusú transzkripciós faktorok vizsgálata Aspergillus nidulans fonalas gombában(2024) Kocsis, Beatrix; Leiter, Éva; Gyógyszertudományok doktori iskola; Természettudományi és Technológiai Kar; Természettudományi és Technológiai Kar::Biotechnológiai Intézet; Természettudományi és Technológiai Kar::Biotechnológiai Intézet::Molekuláris Biotechnológiai és Mikrobiológiai TanszékA dimer bázikus leucin cipzár (bZIP) fehérjék konzervált transzkripciós enhancerek, amelyek minden eukariótában megtalálhatók. Kritikus, gyakran fajspecifikus szerepet töltenek be a szervezet fejődésének számos vonatkozásában . Az eukariótákban változatos szerepük van az egyes sejttípusok differenciációjában, azok fenntartásában, de részt vesznek emellett különböző stresszválaszokban, a sejtproliferáció szabályozásában, illetve a homeosztázis fenntartásában. Ezen bZIP transzkripciós faktorok fonalas gombákban a különböző fejlődési folyamatok, a stresszválaszok és a szekunder metabolit termelés fontos szabályozóiként szerepelnek. Jelen értekezés célja volt az A. nidulans fonalas gomba bZIP-típusú transzkripciós faktorait kódoló atfA és atfB géneknek a funkcionális analízise, valamint újgenerációs RNS szekvenálással a deléciós mutánsok (ΔatfA, ΔatfB, ΔatfAΔatfB) transzkriptomikai tanulmányozása. Az atfA és atfB gének élettani funkcióinak analíziséhez létrehoztuk a deléciós és a túltermelő mutánsokat az összes kombinációban: ΔatfA, ΔatfB, ΔatfAΔatfB, ΔatfAatfBOE, ΔatfBatfAOE. atfAOE, atfBOE és atfAOEatfBOE. Kísérleteink megerősítették hogy az AtfA az oxidatív stresszel szembeni védekezésben játszik szerepet, valamint igazoltuk, hogy az ivaros szaporodásban is kulcsfontosságú, deléciója esetén (önmagában vagy az atfB deléciójával együtt) a kleisztotéciumok képződése elmaradt. Az ivaros szaporodás és a szekunder anyagcsere között fennálló szoros kapcsolatot bizonyította az a tény, hogy az atfA deletált törzs ivaros szaporodási zavarával egyidőben a sterigmatocisztin mikotoxin szintézis leállása következett be. Az AtfB funkciójával kapcsolatban világossá vált, hogy elsősorban a hő és a nehéz fém stressz elleni védelemben játszik szerepet, valamint a konídiospórák fejlődését is szabályozza, befolyásolva a konídiumok mennyiségét. Eredményeinkből kiderült továbbá az, hogy bizonyos élettani funkciókat mindkét bZIP transzkripciós faktor szabályoz, erre láttunk példát a hőstresszt, az ivaros szaporodást, konidiospóraképzést és a sterigmatocisztin termelést vizsgáló kísérleteinknél. A kontroll és a deléciós törzsek transzkriptomjának összehasonlító analízise rámutatott az A. nidulans stresszválaszaiban elsődleges bZIP TF funkciót betöltő AtfA-val kapcsolatban arra, hogy ezen gén hiányában a micélium és konídium mintáknál egyaránt jóval nagyobb számban találtunk alul-és felülszabályozott géneket illetve, hogy az AtfB-függő gének AtfA-tól való függéssel szintén jellemezhetők voltak. A két fejlődési állapot esetében azt a következtetést tudtuk levonni, hogy a konídium mintáknál az atfA és atfB mRNS szintje jóval magasabb volt, illetve több AtfA és AtfB-függő gént tudtunk azonosítani. Az MSB-vel történő kezelés hatására a csak AtfB-függő gének száma csökkent jelentős mértékben, ami pedig a kontroll törzs MSB-kezelt micélium mintájának és a ΔatfA mutáns konídium mintájának mRNS szintjének csökkenését idézte elő. Megállapítottuk, hogy az MSB kezelt és a kezeletlen minták AtfA-függő génjei közötti átfedés a micélium mintáknál alacsony volt. A génexpressziós vizsgálattal tehát feltártuk, hogy az atfA és atfB gének sejttípus-függést mutató szabályozó szereppel jellemezhetők a vizsgált A. nidulans fonalas gomba esetén, emellett, hogy az AtfA sokkal fontosabb szerepet tölt be a szabályozási hálózat elemeként, mint az AtfB. Összességében elmondható, hogy eredményeink szerint az AtfA és AtfB között valószínűleg egy olyan interakció valósul meg, amely a stressztoleranciában, ivaros és ivartalan szaporodásban, valamint a szekunder metabolit termelésben résztvevő gének expresszióját képes szabályozni. Ezért további kutatási terveink között szerepel ezen feltételezett interakció bizonyítása. Így tervezzük a promótereken lévő AtfA és AtfB kötőhelyek genomszintű meghatározását kromatin-immunprecipitációs szekvenálással (ChIP-Seq), valamint az AtfA-AtfB heterodimer képzés igazolását bimolekuláris fluoreszcencia komplementációs (BiFC) technikával.Tétel Szabadon hozzáférhető Could the transcription factor AtnN coordinating the aspercryptin secondary metabolite gene cluster in Aspergillus nidulans be a global regulator?(2024) Kocsis, Beatrix; Boldizsár, Imre; Kovács, Gábor M.; Nagy, Tibor; Gyémánt, Gyöngyi; Csillag, Kinga; Pócsi, István; Leiter, ÉvaTétel Szabadon hozzáférhető Functional analysis of the bZIP-type transcription factors AtfA and AtfB in Aspergillus nidulans(2022) Kocsis, Beatrix; Lee, Mi-Kyung; Yu, Jae-Hyuk; Nagy, Tibor; Daróczi, Lajos; Batta, Gyula; Pócsi, István; Leiter, ÉvaTétel Szabadon hozzáférhető Genome-Wide Gene Expression Analyses of the AtfA/AtfB-Mediated Menadione Stress Response in Aspergillus nidulans(2023) Kocsis, Beatrix; Lee, Mi-Kyung; Antal, Károly; Yu, Jae-Hyuk; Pócsi, István; Leiter, Éva; Emri, TamásTétel Korlátozottan hozzáférhető Egy kis móltömegű antifungális fehérje (PAF) feltételezett receptorának heterológ expressziója(2010-05-07T06:52:34Z) Kocsis, Beatrix; Leiter, Éva; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA PAF egyik feltételezett receptorának az A. nidulans GprA fehérje N terminálisának termelés optimalizálása E. coli expressziós rendszerben.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A sebek mikrobiológiája és a sebkezeléssel kapcsolatos megközelítések(2014-05-05T08:55:02Z) Kocsis, Beatrix; Borbély, György; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetMikrobiológiai szempontból a normál, ép bőr elsődleges szerepe a bőr felszínén élő mikrobiális populáció szabályozása valamint annak megakadályozása, hogy potenciális kórokozók megtelepedjenek a bőr alatt található szövetekben illetve azokat elárasszák.. Miután a bőr integritását elveszíti, azaz egy seb keletkezik, a bőr alatti szövetek védtelenné válása egy nedves, meleg és tápanyagban gazdag környezetet hoz létre, amely mikrobiális kolonizációt és proliferációt idéz elő. Azonban bármely sebtípusról is legyen szó, a mikroorganizmusok nagy mennyiségben való előfordulását és azok sokféleségét az olyan tényezők befolyásolják mint például a seb típusa, mélysége, elhelyezkedése és minősége, a szöveti perfúzió mértéke illetve a gazdaszervezet immunválaszának mikrobákkal szemben kifejtett hatékonysága. Miközben a tiszta, műtéti sebek várhatóan minimális mikroflórával rendelkeznek, a traumás sebeknél a mikroorganizmusok és a devitalizált szövetek valószínűleg elősegítik a mikrobiális proliferációt, hacsak nem hajtottak végre megelőző céllal, korai antibiotikumos kezelést és sebészi sebtisztítást.Tétel Szabadon hozzáférhető Shed Light in the DaRk LineagES of the Fungal Tree of Life-STRES(2020) Selbmann, Laura; Benkő, Zsigmond; Coleine, Claudia; de Hoog, Sybren; Donati, Claudio; Druzhinina, Irina S.; Emri, Tamás; Ettinger, Cassie L.; Gladfelter, Amy S.; Gorbushina, Anna; Grigoriev, Igor V.; Grube, Martin; Gunde-Cimerman, Nina; Karányi, Zsolt; Kocsis, Beatrix; Kubressoian, Tania; Miklós, Ida; Miskei, Márton; Muggia, Lucia; Northen, Trent; Novak-Babič, Monika; Pennacchio, Christa; Pfliegler, Valter Péter; Pócsi, István; Prigione, Valeria; Riquelme, Meritxell; Segata, Nicola; Schumacher, Julia; Shelest, Ekaterina; Sterflinger, Katja; Tesei, Donatella; U'Ren, Jana M.; Varese, Giovanna C.; Vázquez-Campos, Xabier; Vicente, Vania A.; Souza, Emanuel M.; Zalar, Polona; Walker, Allison K.; Stajich, Jason E.