A mikrobiom a humán szervezetben élő kommenzalista, szimbióta és patogén baktériumok, továbbá ősbaktériumok, vírusok és egysejtű eukarióták valódi ökológiai közössége. A Humán Mikrobiom Projektet (HMP) az amerikai National Institute of Health hívta életre kombinálva olyan új, nagy hatékonyságú molekuláris biológiai módszereket, mint az újgenerációs szekvenálás a hagyományos piroszekvenálással és PCR technikákkal. A HMP célja, hogy részletesen feltérképezze a teljes humán ökoszisztémát, továbbá, hogy megállapítsa, a különböző kóros elváltozásokat kísérő mikrobiom alterációkat. Jelen szakdolgozat készítése során célul tűztem ki, hogy részletes irodalmi áttekintést nyújtsak a néhány éve indult, de máris számos fontos eredményt nyújtó HMP-ről. Célom volt továbbá, hogy átfogó képet nyújtsak arról, hogyan módosul a mikrobiom szerkezete különböző környezeti ingerekre. Gyakorló dietetikusként külön figyelmet fordítottam a táplálkozási szokásokat és az elhízást kísérő mikrobiom változásokra, továbbá áttekintést készítettem az különböző szénhidrát rostszerkezetek és a mikrobiom kapcsolatáról.