Az IBD genetikai, környezeti és immunológiai tényezők együtthatása eredményeként alakul ki. A colitis ulcerosa és Crohn betegség kiváltásában és fenntartásában ezek különböző mértékben vesznek részt, különbözik az immunsejtek valamint a gyulladásos cytokinek száma és aránya is. A gyulladás hátterében zajló komplex immunológiai folyamatoknak részese az EDRF-NO rendszer mely, a szervezet egyik általános és alapvető mediátorát és effektorát az NO-t termeli. A NO az egyik legkisebb biológiailag aktív molekula, mint ubiquiter szabadgyök, mennyiségétől, keletkezési helyétől és idejétől valamint a környezetében zajló reakcióktól és a pH-tól függően pozitív vagy negatív szereppel bír a gyulladásos folyamatokban. A NO-nak a vizsgálata colitis ulcerosában és Crohn betegségben ellentmondó eredményekhez vezetett. Colitis ulcerosában intenzív iNOS immunreaktivitást találtunk a hámsejtekben, a nyálkahártya gyulladásos sejtjeiben, ugyanakkor az eNOS az érképletek endotheliumában nem különbözött a kontrolltól. Crohn betegségben, mind az iNOS mind az eNOS szint alacsonyabb volt a nyálkahártya leukocita típusú sejtjeiben, illetve az endothelben. A szöveti „remodelling” része a neovascularizáció, amit markánsan jelzett a CD31 immunreaktív kapillárisok jelenléte a csökkent eNOS pozitivitást mutató endothel sejtek mellett. Az iNOS immunreaktív sejtek colitis ulcerosában főleg neutrofilek, míg Crohn betegségben makrofágok. A NADPH-diaforáz és az iNOS reakciók megjelenése és intenzitása azonos volt, viszont jelentős különbséget lehetett észlelni a colitis ulcerosás és Crohnos minták között, ezért a NADPH-diaforáz festés egy egyszerű, olcsó és könnyen kivitelezhető módszer lehet az IBD két fő típusának elkülönítésében. Az iNOS és az eNOS expresszió különböző colitis ulcerosában és Crohn betegségben. A NO különböző szerepet játszhat a gyulladás kiváltásában és szabályozásában IBD-ben. A NOS izoformák megjelenésében és szöveti eloszlásában észlelt különbségeknek szerepe lehet a colitis ulcerosa és a Crohn betegség szöveti elkülönítésében. Colitis ulcerosás szérum hatására az iNOS és az eNOS indukciója és jelentős expressziója volt észlelhető HUVEC-n. Crohnos szérum az iNOS expresszió átmeneti emelkedését és párhuzamosan az eNOS expresszió határozott csökkenését okozta. Az apoptótikus és nekrótikus sejtek száma jelentős változást nem mutatott, a citoszkeleton megőrizte strukturális integritását. A HUVEC-en végzett vizsgálati eredmények egybevágnak a vastagbél biopszia immunhisztokémiai eredményeivel, és olyan cytokin komplexum jelenlétére utalnak a IBD-s szérumban mely az eNOS/iNOS arányt megváltoztatja endotheliális sejtekben. A Crohnos szérum bizonyos komponensei csökkentik az eNOS fehérje szintjét az endotheliumban, ami befolyásolja a betegség pathomechanizmusát kóros változásokat okozva a gyulladt szövet érrendszerében.