Egyetértés van abban, hogy a lézersugárzásnak lehetősége van a mikroorganizmusok elpusztítására, valamint a törmelék és a smear layer eltávolítására a gyökércsatornákból. A fertőtlenítés terén nincs elegendő bizonyíték arra, hogy bármely speciális lézer jobb lenne a hagyományos endodontikus kezelésnél. Az Erbium és a Nd: YAG hullámhosszak használhatók a gyökércsatorna tisztításhoz és fertőtlenítéshez, az Erbium források a lézerrel aktivált irrigációhoz és foton indukált fotoakusztikus áramláshoz. Az előbb említett két technika viszont bíztató jeleket ad arra utalóan, hogy hova képes fejlődni a dezinficiálás, valamint bizonyos esetekben 100%-os bakteriális redukciót sikerült elérni, ami egyre közelebb visz a végső célhoz. Végül a lézer használata nem ajánlott a NaOCl alternatívájaként egyelőre, hanem a hagyományos fertőtlenítési és tisztítási protokollok kiegészítéseként. Bár bíztató eredményeket értek el, további klinikai randomizált vizsgálatokra van szükség a lézer használatát követő endodontikus kezelés eredményének értékeléséhez.