A gasztrointesztinális traktus (GIT) a test és a külső környezet közötti interfészként szolgál. Egy rendkívül speciális szervrendszer, amelynek legfontosabb feladata a szervezet tápanyagigényének kielégítése az emésztésen keresztül. A bélmikroflórát a szervezetre gyakorolt ismert hatása miatt az "elfelejtett szervnek" is nevezik. Valószínűleg a leginkább tanulmányozott szimbiotikus rendszer. A hosszú távú kölcsönhatások révén a gazdaszervezet és a mikroorganizmusok között egymástól való függés jött létre. Jelentősége gazdasági állataink esetében is nagy. A bélben lévő mikroflóra ökoszisztéma jellemzői befolyásolhatják a bél lumenének morfológiáját, metabolikusan módosíthatják a lumenben lévő exogén és endogén tápanyagokat, az immunrendszer működését, aktív szerepet játszhatnak a patogén kontrollban, és befolyásolhatják az állat takarmány igényeit. Ha egy állat mikroflóra ökoszisztémája instabil, a tápanyag forgalom veszélybe kerül. A tanulmány elsődleges célja a vastagbél, valamint a mikroflóra jelentőségének bemutatása