Az orális mikrobiom egy rendkívül összetett és a fajok számát tekintve gazdag közösség. A plakkban jelenlévő baktériumok között szinergista illetve antagonista kölcsönhatás léphet fel. Külső tényezők hatására a köztük lévő kapcsolat és szimbiózis elmozdulhat a diszbiózis irányába. A baktériumok közötti kölcsönhatásokra és az arányuk alakulására hatással van az immunrendszer, a nyál, dohányzás, táplálkozás és egyes vírusok jelenléte is. A parodontális gyulladás a bakteriális biofilmre adott védekező válaszként kezdődik. Kezdetben gingivitis figyelhető meg majd a tartós ínygyulladás idővel parodontitissé fejlődhet, amely már irreverzibilis.