Diszregulált miRNS-ek Wilms-tumorban és lehetséges célpontjaik

Fájlok
Dátum
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

Bevezetés: A Wilms-tumor a vese malignus daganatos elváltozása, mely leggyakrabban 10 év alatti gyermekek körében fordul elő. Célkitűzés: miRNS-profilozás 10 primer típusú Wilms-tumor szöveti FFPE mintából, valamint 10 kontrollmintából, és az expressziós eltérést mutató miRNS-ek célpontjainak feltárása. Módszer: A minták formalinban fixált paraffinba ágyazott (FFPE) szöveti blokkok, melyek metszeteket tartalmaztak a tumorból és a környező ép szövetekből is külön-külön, ezáltal lehetőség nyílt a tumoros minták eltéréseit a hozzájuk tartozó normál szövethez viszonyítani. Ezekből a szöveti mintákból miRNS-eket izoláltunk, melyekből reverz transzkripció segítségével cDNS-átiratot készítettünk. A miRNS-ek expressziós szintjének megállapításához qRT-PCR-t végeztünk egy PCR array segítségével, mely 84 egyedi primert tartalmaz Wilms-tumorban és egyéb urogenitális daganatokban gyakran előforduló miRNS-ek ellen. A qRT-PCR-t 4 endogén kontroll átlagához viszonyítva értékeltük ki. A ΔCt értékeket kiszámítottuk a normál szöveti mintákra és a primer tumorokra egyaránt az expressziós szintek különbségének statisztikai vizsgálatához. A 10 tumoros és 10 kontroll minta alapján kétmintás t-próbát végeztünk. Ennek eredményeként 11 olyan miRNS-t kaptunk, ahol a ΔCt értékek közötti különbségek 0,05-ös vagy alacsonyabb p-értéket mutattak. Ezen miRNS-ek lehetséges célpontjait in silico analízissel a MIENTURNET (MIcroRNAENrichmentTURnedNETwork) adatbázis segítségével vizsgáltuk. Eredmények: Az in silico analízis alapján a 11 miRNS-nek 4 fő fehérje-célpontját lehet kiemelni: apoptosis regulator BCL-2, zinc finger protein ZFPM2, zinc finger E-box-binding homeobox 1 (ZEB1) és 2 (ZEB2) fehérjék. Ezek a fehérjék az apoptózisban, gonadalis differenciálódásban, fokális adhézióban és az epithelium-mesenchyma tranzícióban játszanak szerepet. Konklúzió: A kutatásunk gyarapítja a Wilms-tumor tumorigenesisének ismeretanyagát, és olyan miRNS-eket, fehérjecélpontokat prezentál, melyek lehetséges célpontjai lehetnek a diagnosztikának, terápiának. További vizsgálatok szükségesek a fehérjecélpontok igazolásához.

Leírás
Kulcsszavak
Wilms-tumor, miRNS, in silico analízis, qPCR
Forrás