Genetikai mintázat és képalkotás összefüggései gliomák esetében

Dátum
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt

Szakdolgozatom célja a glioblastoma multiformenak a radiogenomikai vizsgálati lehetőségeinek feltérképezése volt. Ehhez szakirodalom felhasználásával és laboratóriumi munkával a túlélés becslésben egyik legszéleskörűbben elfogadott biomarkert, a O6-metilguanin-DNS metiltranszferáz promoter régió metilációját vizsgáltam. A gén promoterében található CpG szigetek metilációja a gén inaktiválódásához vezet. A gén inaktivációjának a glioblastoma alkiláló kemoterápiás szerrel történő kezelésekor van jelentősége. Az MGMT által kódolt fehérje, mint repair enzim eltávolítja az alkil csoportokat, így ez a típusú kemoterapeutikum hatástalan lesz. (Siegal, 2015) A Debreceni Egyetem Általános Orvostudományi Kar Orvosi Képalkotó Intézetének munkájába csatlakoztam be, ahol egy akkor induló, új kutatásban vehettem részt. A glioblastoma multiforme promoter metiláció mértékének kvantitatív meghatározására törekedtünk, és fogunk is a jövőben törekedni. Hosszútávú terveink között szerepel az, hogy radiogenomikai következtetéseket tudjunk levonni: az általunk vizsgált genetikai mintázatokat össze tudjuk vetni a betegek képalkotó eljárásokkal készült eredményeivel, és párhuzamokat tudjunk állítani a felvételek és a metilációs profilok között, ezzel is hozzájárulva a személyre szabott terápia minél szélesebb körben való terjedéséhez. Az elemzéshez glioblastoma multiormes agyszövetekből származó paraffinos mintákat használtunk, melyekből a megfelelő deparaffinálás, DNS izolálás, a tisztaság és a koncentráció ellenőrzés után négy féle restrikciós emésztést készítettünk mintánként, majd SYBR green alapú qPCR technikát használtunk, mely eredményként a metiláltság mértékét százalékos értékben fejezi ki. Vizsgálataink során eddig olyan eredményt nem sikerült kapnunk, amellyel a hosszútávú terveinket meg tudtuk volna alapozni, a kezdeti lépésekkor a módszerbeállítás és a megfelelő technika megtalálása okozta nehézségekbe ütköztünk, de a kísérletek tovább folytatódnak. A fellépő hibák keresése és elhárítása mellett a jövőben a paraffinba ágyazott szövettani minták helyett fagyasztott metszeteket szeretnénk alkalmazni, ezzel is csökkentve a fixálás és a beágyazás során keletkező esetleges DNS károsodás esélyét. Számos szakirodalmi példa is alátámasztja, hogy a glioblastoma vizsgálatában, a túlélés becslésében és a megfelelő kezeléshez szükséges az MGMT metilációs státuszának ismerete, illetve a képalkotás összevetésével párhuzamok figyelhetők meg. Metiláltáságtól függően MR-en megjelenő jellegzetes megjelenéseket is megfigyeltek, azok a glioblastoma multiformék, melyekben a gén promotere nem metilált, a jellegzetes gyűrű-szerű megjelenést mutatják. (ElBanan, 2015) Hypermetilált MGMT promoter esetén nagy a jelentős kontraszthalmozást mutató tumor térfogat aránya az egész tumor térfogathoz képest, a halmozó területek pedig emelkedett CBV és CBF értéket mutattak a környezetükhöz viszonyítva, ami jól mutatja a gliomák e típusára jellemző vascularisaltságot. (Kickingereder, 2016) Az MGMT promoter metilációjának vizsgálata így kiemelt szerepet kap a daganatos betegek személyre szabott kezelése során, radiogenomikai jelentőségére pedig egyre több bizonyíték utal, jövőbeli kísérleteinkkel mi is ehhez szeretnénk hozzájárulni.

Leírás
Kulcsszavak
glioblastoma, MGMT, metiláció, radiogenomika, molekuláris biológia, glioblastoma multiforme
Forrás