Vadmadarak szerepe az antibiotikum rezisztencia terjedésében

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorKardos, Gábor
dc.contributor.authorNagy , József Bálint
dc.contributor.departmentGyógyszertudományok doktori iskolahu
dc.contributor.submitterdepÁltalános Orvostudományi Kar
dc.contributor.submitterdepÁltalános Orvostudományi Kar::Orvosi Mikrobiológiai Intézet
dc.date.accessioned2024-05-13T19:17:18Z
dc.date.available2024-05-13T19:17:18Z
dc.date.created2024
dc.date.defended2024-05-30
dc.description.abstractAz Egy egészség elv tekintetében az emberek és az állatok egészsége és a környezet szoros kölcsönhatásban áll egymással, ami az antibiotikum rezisztenciára is vonatkozik, ennek fényében pedig vadmadarak szerepét vizsgáltuk az antibiotikum rezisztencia terjedésében. A 2016. október és 2017. március között vizsgált vetési varjak 33%-ában, a rutin diagnosztikai vizsgálatra érkező humán székletminták 1,7%-ában találtunk ESBL-termelő E. coli-t. Az ESBL gének szekvenálásából kiderült, hogy a varjakban a blaCTX-M-55 és blaCTX-M-27 gének, míg a humán széklet és klinikai mintákban a blaCTX-M-15 és blaCTX-M-27 domináltak. A PFGE alapján a humán klinikai és széklet izolátumok jól elkülönültek a varjú izolátumoktól néhány kivétellel. Az ST131 a varjú, széklet és klinikai mintákban is előfordult, a domináns alklád a C1-M27 volt. Az EC069-es PFGE klaszterbe tartozó varjú eredetű ST131 C1-M27 izolátumok WGS és cgMLST alapján közeli kapcsolatban álltak a humán izolátumokkal. A varjakban ST24-be tartozó atipikus EPEC törzsek, blaCTX-M-55 hordozó ST162 törzsek és APEC törzsek is előfordultak. A 2019 és 2020-ban mintázott dankasirályok 7,4%-a illetve 6,7%-a hordozott CRE törzset, a Duna esetében csak a 2020-as Budapest alatti szakaszból gyűjtött mintákban találtunk CRE-t. A domináns faj az E. coli volt, ezeket hasonlítottuk össze humán carbapenem rezisztens E. coli (CREc) törzsekkel. A WGS eredménye alapján a blaNDM-1 volt a domináns karbapenemáz gén, melyek közvetlen genetikai környezete minden esetben ugyanaz volt. A sirály és dunai izolátumokban a blaVIM-4 csak blaNDM-1-gyel együtt volt jelen, míg a klinikai izolátumokban önmagában, vagy a blaOXA-48-cal együtt fordult elő. Alapvetően az emberi, vízi és sirály CREc izolátumok különböző ST-okba tartoztak. A klinikai izolátumok döntő többségét jellemzően humán patogén ST-ok adták, de a sirály és dunai törzsek között is találtunk fontos magas kockázatú klónokat (ST224, ST372, ST744 és ST10, ST354, ST410). A humán és sirály izolátumok között nem találtunk közvetlen kapcsolatot. A dunai és humán ST410 törzsek kapcsolatban álltak egymással. A 2019-ben gyűjtött ST1437 törzsek teljesen azonosak voltak míg a 2020-as sirály és dunai izolátumok között 22-24 allél allélnyi különbség volt. A mindenevő, urbanizált, kóborló és vándorló viselkedésük miatt ezek a sirályok és varjak fontos rezervoárok, helyi és hosszútávú vektorok a rezisztens törzsek, MGE-ek és rezisztencia gének számára, felhívva ezzel a figyelmet a vadmadarak szerepére illetve az Egy egészség elv fontosságára az antibiotikum rezisztencia terjedésében
dc.description.abstractThe One Health concept sets forth that the health of the animals, humans and the environment is interconnected and it also applies to antibiotic resistance. Thus, we examined the role of wild birds in the dissemination of antibiotic resistance. Between October 2016 and March 2017 the prevalence of ESBL-producing E. coli in rooks was 33% while the asmyptomatical carriage was 1.7% in human stool samples. ESBL genes were sequenced; rook isolates carried mostly blaCTX-M-55 or blaCTX-M-27 genes while blaCTX-M-15 and blaCTX-M-27 dominated in human stool and clinical isolates. Based on PFGE clinical and stool isolates clustered separately from rook isolates with minor exceptions. ST131 clone was present in rooks, stool and clinical samples C1-M27 being the dominant subclade. EC069 PFGE cluster contained rook, stool and clinical isolates belonging to ST131 C1-M27 subclade which were in close connection based on WGS and cgMLST results. Rooks carried ST24 atypical EPEC strains, blaCTX-M-55 harbouring ST162 strains and APEC strains. Overall 7.4% and 6,7% of sampled gulls in 2019 and 2020 carried CRE, respectively. CRE was found in the Danube only in samples taken in 2020 downstream of Budapest. E. coli was the dominant species and these CREc isolates were compared to human clinical strains. Based on WGS the predominant carbapenemase was blaNDM-1 located within the same immediate genetic context in all isolate collections. In gull and river isolates blaVIM-4 occurred only in blaNDM-1 carriers while it was carried alone or with blaOXA-48 in human isolates. Though human river and gull isolates belonged to different STs, shared STs between sample types were also found. Most human isolates belonged to typical human pathogen STs but important high-risk clones were also found in gulls and Danube (ST224, ST372, ST744 and ST10, ST354, ST410, respectively). Direct link was not found between gull and human isolates. Human and river ST410 isolates were connected. Gull ST1437 isolates found in 2019 were identical while those collected in 2020 from gulls and Danube had 22-24 allelic distances between them. Because of their omnivorous, urbanised, vagrant and migratory behaviour these gulls and rooks are serious reservoirs, local and long-range vectors for the resistant strains, MGEs and resistance genes highlighting the role of wild birds and the importance of One Health in the dissemination of antibiotic resistance.
dc.format.extent89
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/369948
dc.language.isohu
dc.language.isoen
dc.subjectESBL, CRE, városi madarak, ST131 C1-M27, Egy egészség elv, blaCTX-M-15, blaNDM-1, ST410, ST1437, Duna, sirály, varjú
dc.subjectESBL, CRE, urbanised birds, ST131 C1-M27, One Health, blaCTX-M-15, blaNDM-1, ST410, ST1437, Danube, gull, rook
dc.subject.disciplineGyógyszertudományokhu
dc.subject.sciencefieldOrvostudományokhu
dc.titleVadmadarak szerepe az antibiotikum rezisztencia terjedésében
dc.title.translatedRole of wild birds in the dissemination of antibiotic resistance
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 4 (Összesen 4)
Nincs kép
Név:
Nagy József Bálint_értekezés.pdf
Méret:
3.6 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Nincs kép
Név:
Nagy József Bálint_magyar tézis.pdf
Méret:
893.28 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Nincs kép
Név:
Nagy József Bálint_angol tézis.pdf
Méret:
588.19 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Nincs kép
Név:
Meghívó.pdf
Méret:
254.29 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
1.93 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Gyógyszerészeti Tudományok Doktori Iskola