Fajazonosításra számos molekuláris biológiai és analitikai módszer alkalmazható, melyek fajspecifikus markerek kimutatásán alapulnak. Szakdolgozati munkámban a halfajokat fehérjemintázatuk alapján azonosítottuk izoelektromos fókuszálás segítségével. A vizsgálat során 15 különböző halfaj nyers, izomszöveti mintáiból izolált vízoldékony fehérjéket választottunk el izoelektromos pontjuk alapján. Az izoelektromos fókuszálást az alábbi fajokkal végeztük el: karika keszeg, dévérkeszeg, ponty, széles kárász, folyami géb, naphal, európai harcsa, fekete törpeharcsa, fogassüllő, kősüllő, menyhal, sebes pisztráng, szivárványos pisztráng, balin, bodorka. A kísérlet során sikerült azonosítanunk számos olyan fehérjét, amelyek elektroforetikus mintázata csak az adott fajra jellemző, így az izoelektromos fókuszálás alkalmasnak bizonyult a fajazonosításra. Továbbá hőkezelt ponty (Cyprinus carpio, L.) húsmintákkal is elvégeztük az izoelektromos fókuszálást, és a kapott fehérjemintázatokat összehasonlítottuk a nyers egyedek esetében kapott mintázattal. A 10 percig főzött, illetve sütött halak esetén, bár jelen volt a fajspecifikus mintázat, de újabb sávok is megjelentek a fehérjék hő hatására bekövetkező degradációja miatt, ami az azonosítást nehezíti. A 20 percig főtt halak esetében már annyi új sáv jelent meg, hogy a kapott mintázat nem tekinthető fajspecifikusnak.