Protein S deficiens betegek MLPA analízise
Absztrakt
A protein S (PS) egy természetes antikoaguláns, fontos szerepet játszik a véralvadás szabályozásában. A trombophilia hátterében, öröklött és szerzett tényezők egyaránt állhatnak. Az egyik legfontosabb öröklött tényező a protein S deficiencia (PSD), melynek három típusa van. Az I. és a III. típus – kvantitatív (mennyiségi) hiba, a II. típus – (kvalitatív) minőségi hiba. Célunk volt tanszékünkre 2014-2021 között PS deficiencia molekuláris genetikai hátterének felderítése céljából érkezett betegek (n=330) esetén a PS mutáció detektálási arány, a mutációs spektrum és az I-es/II-es típusok megoszlásának a meghatározása. Néhány betegnél (n=20) felmerült a PS gén nagy szakaszát érintő elváltozás, amit multiplex ligáció függő próba amplifikáció (MLPA) módszerrel terveztünk elvégezni. A Sanger szekvenálás során összesen 63 beteg esetén volt kimutatható patogén/feltételezhetően patogén mutáció, mely a vizsgált személyek ~20%-át jelentette. Ezek többsége, ~95%-a I. típusú, ~5%-a II. típusú deficienciának felel meg. Minden esetben heterozigóta formában voltak kimutathatóak az említett eltérések. A mutációk ~24%-a az irodalomban még nem ismertetett új mutáció. A detektált mutációk 93%-a misszensz mutáció, 1,5%-a deléció és 1,5%-a inzerció és 6%-a eredményezett stop kodont (trunkált fehérjét). A Sanger szekvenálás során „mutációnegatívnak” bizonyult és rendkívül alacsony PS aktivitást mutató betegek esetében MLPA módszerrel vizsgáltuk meg a nagyobb génszakaszokat érintő eltéréseket. Egy beteg esetében delécióval járó nagy eltérést mutattunk ki. Megállapítottuk, hogy nagy génszakaszokat érintő eltérések igen ritkán detektálhatók hazánkban a PROS1 génben, továbbá, hogy a PS deficienciák hátterében gyakori (alapító) mutáció sem mutatható ki. Az esetek jelentős többségében I. típusú deficiencia áll a betegség hátterében. Az MLPA módszerrel egyetlen beteg esetében igazoltunk nagy méretű deléciót, melynek pontos karakterizálását kvantitatív vagy „long” PCR-rel tervezzük elvégezni a jövőben.