A szájüregi laphámrák (oral squamous cell carcinoma - OSCC) a 6. leggyakoribb daganat világszerte. A genetikai fogékonyság mellett a fő etiológiai faktorok közé tartozik a dohányzás és a tartós alkoholfogyasztás. Az oralis leukoplakia (OLK) egyike az OSCC rákmegelőző állapotainak, makroszkóposan a nyálkahártyán megjelenő lekaparhatatlan fehér plakk. Másik ismert premalignus állapot az oralis lichen planus (OLP), amely a szájnyálkahártyát érintő, immunmediált eredetű kórkép. A korai diagnózis felállítása kritikus, ugyanis a már későn diagnosztizált daganat 5 éves túlélési aránya csupán 50%. Napjainkban az OSCC diagnózisát szövettani vizsgálattal támasztják alá. Sajnos jelenleg nincs alkalmazható szűrőteszt a betegség időben történő felfedezéséhez, de a nyál biomarkerek vizsgálata reményt keltő lehet. A vizsgálatunk célja az volt, hogy az általunk létrehozott DIA spektrum könyvtár segítségével vizsgáljuk az egyes betegektől származó nyálmintákat és betegségcsoportokra jellemző nyálfehérjéket azonosítsunk. OLK-ban, OLP-ben, ill. OSCC-ben szenvedő páciensek nyálmintáit vizsgáltuk és a bennük található fehérjéket hasonlítottuk össze korban és nemben illesztett egészséges kontrolloktól származó nyálmintákkal. A minták fehérjekoncentrációinak meghatározását követően tripszines emésztéssel hasítottuk a fehérjéket és információ független adatgyűjtési (DIA) módszerrel nanoUPLC-vel kapcsolt Orbitrap Fusion (ThermoScientific) tömegspektrométerrel vizsgáltuk az emésztményt. Az eredményeket DIA-NN szoftverrel elemeztük, továbbá hálózati analíziseket készítettünk.
Munkánk eredményeként sikerült létrehozni egy olyan DIA spektrumkönyvtárat, amely elősegíti a nyálminták nagyobb érzékenységű vizsgálatát és az egyes betegségcsoportok elkülönítésére alkalmas biomarkerek azonosítását. Eredményeink ily módon hozzájárulhatnak az OSCC korai diagnosztizálásához és az egyes rákmegelőző állapotok elkülönítéséhez.