DIA spektrumkönyvtárak létrehozása és alkalmazása szájüregi laphámrák és daganatmegelőző állapotok vizsgálatára

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorCsősz, Éva
dc.contributor.advisordeptDebreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézethu_HU
dc.contributor.authorBertalan, Petra Magdolna
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Karhu_HU
dc.contributor.opponentBak, István
dc.contributor.opponentdeptDebreceni Egyetem::Gyógyszerésztudományi Kar::Gyógyszerhatástani Tanszékhu_HU
dc.date.accessioned2022-06-07T14:49:12Z
dc.date.available2022-06-07T14:49:12Z
dc.date.created2022
dc.description.abstractA szájüregi laphámrák (oral squamous cell carcinoma - OSCC) a 6. leggyakoribb daganat világszerte. A genetikai fogékonyság mellett a fő etiológiai faktorok közé tartozik a dohányzás és a tartós alkoholfogyasztás. Az oralis leukoplakia (OLK) egyike az OSCC rákmegelőző állapotainak, makroszkóposan a nyálkahártyán megjelenő lekaparhatatlan fehér plakk. Másik ismert premalignus állapot az oralis lichen planus (OLP), amely a szájnyálkahártyát érintő, immunmediált eredetű kórkép. A korai diagnózis felállítása kritikus, ugyanis a már későn diagnosztizált daganat 5 éves túlélési aránya csupán 50%. Napjainkban az OSCC diagnózisát szövettani vizsgálattal támasztják alá. Sajnos jelenleg nincs alkalmazható szűrőteszt a betegség időben történő felfedezéséhez, de a nyál biomarkerek vizsgálata reményt keltő lehet. A vizsgálatunk célja az volt, hogy az általunk létrehozott DIA spektrum könyvtár segítségével vizsgáljuk az egyes betegektől származó nyálmintákat és betegségcsoportokra jellemző nyálfehérjéket azonosítsunk. OLK-ban, OLP-ben, ill. OSCC-ben szenvedő páciensek nyálmintáit vizsgáltuk és a bennük található fehérjéket hasonlítottuk össze korban és nemben illesztett egészséges kontrolloktól származó nyálmintákkal. A minták fehérjekoncentrációinak meghatározását követően tripszines emésztéssel hasítottuk a fehérjéket és információ független adatgyűjtési (DIA) módszerrel nanoUPLC-vel kapcsolt Orbitrap Fusion (ThermoScientific) tömegspektrométerrel vizsgáltuk az emésztményt. Az eredményeket DIA-NN szoftverrel elemeztük, továbbá hálózati analíziseket készítettünk. Munkánk eredményeként sikerült létrehozni egy olyan DIA spektrumkönyvtárat, amely elősegíti a nyálminták nagyobb érzékenységű vizsgálatát és az egyes betegségcsoportok elkülönítésére alkalmas biomarkerek azonosítását. Eredményeink ily módon hozzájárulhatnak az OSCC korai diagnosztizálásához és az egyes rákmegelőző állapotok elkülönítéséhez.hu_HU
dc.description.courseklinikai laboratóriumi kutató mesterképzéshu_HU
dc.description.courseactnappalihu_HU
dc.description.courselangmagyarhu_HU
dc.description.degreeMSc/MAhu_HU
dc.format.extent49hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/334328
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjecttömegspektrometriahu_HU
dc.subjectszájüregi laphámrákhu_HU
dc.subjectbiomarkerhu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Orvostudományhu_HU
dc.titleDIA spektrumkönyvtárak létrehozása és alkalmazása szájüregi laphámrák és daganatmegelőző állapotok vizsgálatárahu_HU
Fájlok
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)