Klinikai Saccharomyces izolátumok genomikai elemzése
Klinikai Saccharomyces izolátumok genomikai elemzése
Dátum
Szerzők
Ádám, Rausz
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt
Az élesztő sejtek(Saccharomyces cerevisiae) evolúciója során gyakran megfigyelhetőek a genom átrendeződései, amelyek megnyilvánulhatnak a ploidia szint változásában, aneuploidiákban, kópiaszám-variációkban (CNV) és heterozigozitás elvesztésében (LOH), ezek a genomi változások elősegítik a gombák gyors alkalmazkodását az új környezetekhez. A folyamatosan változó környezeti feltételek szaporodásra késztetik az élesztő sejteket a túlélés érdekében, így számos mutációt idézve elő. A gyors szaporodás és a tápanyag hiány miatt, az osztódás során bekövetkezhetnek rendellenes osztódási folyamatok, amik a genom megváltozását idézhetik elő. Ezen új mutációk lehetőséget biztosítanak az új környezethez való adaptációhoz. Ezen genomstruktúra-variációk nagyon fontosak a gomba patogének adaptációjában.Ezen genom struktúra variációk detektálása annak érdekében, hogy részletesebb képek kapjunk ezen faj feno- és genotípusáról. A fajok pontosabb azonosítása közelebb vihet minket az olyan opportunista patogén korokozók megértéséhez, mint az S. cerevisiae.
Leírás
Kulcsszavak
Saccharomyces cerevisiae, adaptáció, genomstruktúra variáció, IGV, GATK, YMAP