Gazdasági állatfajok vizsgálata proteomikai módszerek alkalmazásával

Gulyás, Gabriella

Gazdasági állatfajok vizsgálata proteomikai módszerek alkalmazásával

dc.contributor.advisor	Jávor, András
dc.contributor.author	Gulyás, Gabriella
dc.contributor.department	Állattenyésztési tudományok doktori iskola	hu
dc.date.accessioned	2014-09-26T08:56:58Z
dc.date.available	2014-09-26T08:56:58Z
dc.date.created	2014	hu_HU
dc.date.defended	2014-10-29
dc.description.abstract	Munkánk során szarvasmarha, juh és házityúk izom-, illetve májszövetének proteomikai vizsgálatát végeztük el különböző kezelések mellett. A fehérjék elválasztására kétdimenziós poliakrilamid gélelektroforézist ill. kétdimenziós differenciáló gélelektroforézist alkalmaztunk. A gélelektroforézis során készült gélképek mintázatát Delta2D gélelemző szoftver segítségével hasonlítottuk össze, a csoportok között expressziós különbséget mutató fehérjék azonosítása, folyadék kromatográfiával kapcsolt tömegspektrométerrel történt. A házityúk máj proteomjában szelén indukció hatására 8 fehérje expressziója emelkedett meg a kezelt csoportban, míg 5 fehérje expressziója lecsökkent. Az expressziós különbséget mutató fehérjék funkciója alapján arra következtethetünk, hogy az alkalmazott szelén dózis csökkentette a glükoneogenezis és a zsírsav metabolizmus intenzitását, megnövelte a citoszkeletális aktin mennyiségét és ezzel együtt az aktin szabályozását végző fehérje expresszióját, valamint az antioxidáns rendszerre is hatással volt. Szapora merinó és cigája növendék kosok hosszú hátizom szövetének proteomikai elemzése során 7 fehérje a szapora merinóban mutatott magasabb expressziót, míg másik 5 fehérje a cigájában expresszálódott nagyobb mértékben. Az azonosított fehérjéket funkciójuk alapján három csoportba soroltuk: struktúrfehérjék, szénhidrát metabolizmushoz köthető fehérjék és egyéb feladatot ellátó fehérjék. A struktúrfehérjék mindegyike a merinó fajtában mutatott magasabb expressziót, ez a jelenség az intenzív fehérjebeépüléssel lehet összefüggésben. A cigája fajtában a glikolitikus enzimek és a mioglobin overexpressziója, valamint a stresszhez kapcsolódó fehérje expressziós változása a húsminőségi tulajdonságokkal hozható összefüggésbe. Az 500 és 700 kg-os élősúlyban levágott charolais hízóbikák vázizom szövetének proteomikai vizsgálata során megállapítottuk, hogy az alfa-enoláz, a béta-enoláz, a kontraktilis aktin és a triózfoszfát izomeráz fehérjék a 700 kg-os csoportban mutattak magasabb expressziós szintet, e fehérjék overexpressziója magas glikolitikus aktivitásra és erőteljesebb izomnövekedésre utal. Az 500 kg-os csoportban a Hsp27 hősokk fehérje esetén detektáltunk magasabb expressziós szintet. Eredményeink alapján levonhatjuk azt a következtetést, hogy a proteomikai módszerek alkalmasak komplex tulajdonságok vizsgálatára. Ugyan az állattenyésztésben még korlátozott a felhasználásuk, de az ismeretanyag növekedésével és a műszeres technikák fejlődésével párhuzamosan, egyre nagyobb igény mutatkozik a termelési, fiziológiai és patofiziológiai jelenségek mélyebb megértésére. The objectives of the present study were to analyse proteome of muscle and liver tissues of cattle, sheep and chicken in different experiments. Two dimensional polyacrylamide gel electrophoresis or two dimensional - difference in gel electrophoresis was used to separate proteins. Gel images were analyzed and compared with Delta2D software, spots which showed significant differences between groups, were identified with liquid chromatography coupled mass spectrometry In our experiment, we aimed to identify the changes of the proteome of chicken liver caused by selenium induction. Eight proteins showed a higher expression in experimental group, in contrast the expression of other five proteins were reduced in the experimental group. Based on our results can we conclude that the applied dose of selenium reduced the intensity of gluconeogenesis, increased the quantity of cytoskeletal actin and the expression of actin regulatory protein as well. The selenium treatment could affect the metabolism of fatty acids and the antioxidant system. A proteomic study was performed on musculus longissimus dorsi tissues of rams belong to Merino and Tsigai breeds. Seven of the identified proteins have shown higher expression in Merino breed, while other 5 proteins overexpressed in Tsigai group. All of these proteins belong to three groups based on their functions, such as structural proteins, carbohydrate metabolism-related proteins, and miscellaneous proteins. All of the structure proteins have shown higher expression in Merino breed, this can be in connection with intensive protein anabolism. Overexpression of glycolytic enzymes and myoglobin, and lower expression of stress-induced-protein can be in connection with meat quality parameters. As a result of proteomic analysis of skeletal muscle tissues of Charolais bulls with live weight of 500 and 700 kg, we concluded that alpha-enolase, beta-enolase, skeletal muscle actin, and triosephosphate isomerase proteins showed the higher expression level in the group of 700 kg bulls, those can indicate higher glycolytic activity and muscle development. While the expression of heat shock protein beta-1 was higher in the group of 500kg bulls. In conclusion, the proteomic methods are appropriate to investigate complex traits. However their application in animal science is limited, but in parallel with growth of knowledge and development of state-of-art methods, there is an increasing demand for understanding the molecular background of animal production, physiological and pathophysiological traits of livestock species.	hu_HU
dc.description.corrector	NE
dc.format.extent	129	hu_HU
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/2437/197534
dc.language.iso	hu	hu_HU
dc.language.iso	en	hu_HU
dc.subject	proteomika	hu_HU
dc.subject	kétdimenziós gélelektroforézis
dc.subject	házityúk
dc.subject	juh
dc.subject	szarvasmarha
dc.subject	szelén
dc.subject	proteomics
dc.subject	two dimensional gel electrophoresis
dc.subject	chicken
dc.subject	sheep
dc.subject	cattle
dc.subject	selenium
dc.subject.discipline	Állattenyésztési tudományok	hu
dc.subject.sciencefield	Agrártudományok	hu
dc.title	Gazdasági állatfajok vizsgálata proteomikai módszerek alkalmazásával	hu_HU
dc.title.translated	Application of Proteomic Tools in Livestock Science	hu_HU